OYAK ve Danıştay arasındaki ilişki, çeşitli hukuki ve soruşturma konularıyla gündeme gelmiştir: Danıştay'a ait kamera kayıtlarının silinmesi: 2010 yılında, Danıştay'a güvenlik hizmeti veren OYAK'ın eski genel müdürü Orhan Çoban hakkında, Danıştay'daki kamera kayıtlarının silinmesiyle ilgili soruşturma başlatılmıştır. OYAK Çimento hisselerinin satışı: OYAK'ın, OYAK Çimento Fabrikaları A.Ş.'deki hisselerinin piyasa değerinin altında bir fiyata satışı iddiasıyla ilgili olarak, eski yönetim hakkında Ankara Cumhuriyet Başsavcılığı'na suç duyurusunda bulunulmuştur. Erdemir'in özelleştirilmesi: Danıştay 13. Dairesi, Erdemir'in OYAK'a satışına izin veren Özelleştirme Yüksek Kurulu kararının yürütmesini durdurmuştur. Ayrıca, 2025 yılında, OYAK'ın önceki dönem yöneticileri hakkında, kurumun kasıtlı olarak yaklaşık 5 milyar TL zarara uğratıldığı iddiasıyla suç duyurusunda bulunulmuştur.