Bu video, bir sunucu ve Çukurova Üniversitesi'nde istatistik eğitimi almış, bioinformatik master ve doktora yapmış, şu anda İsveç'te Carliska'da doktora sonrası araştırmacı olarak görev yapan Deniz adlı bir uzmanla yapılan röportajdır.. Röportajda biyoinformatik kavramı, bu alana nasıl ilgi duyulduğu, gerekli eğitim yolları ve kariyer seçenekleri ele alınmaktadır. Video, biyoinformatikin temel kavramlarından başlayarak, uygulama alanlarına, kullanılan programlama dillerine (Python, MATLAB), yapay zeka araçlarının kullanımına ve biyoinformatikin gelecekteki önemi hakkında bilgiler sunmaktadır.. Röportajda ayrıca biyoinformatikin protein yapıları, ilaç geliştirme, patolojilerin anlaşılmasındaki rolü, genetik hastalıkları anlamamıza katkıları ve gelecekte her bilim insanının öğrenmesi gereken bir konu haline geleceği görüşü de paylaşılmaktadır. Konuşmacı, biyoinformatikin gelecekte lise seviyesine kadar yayılacağını ve biyoloji derslerini içerecek şekilde yeniden düzenlenmesi gerektiğini düşünmektedir.
NGS determines DNA/RNA sequence for genetic variation analysis. Introduced in 2005 as massively-parallel sequencing. Enables simultaneous analysis of hundreds to thousands of genes. Offers higher accuracy and lower sample requirements than Sanger sequencing
Bu video, bir öğrencinin günlük hayatını ve yeni rutinini paylaştığı bir vlog formatındadır. Konuşmacı, biyoinformatik alanında uzmanlaşmak için biyo-istatistik dersleri alan bir öğrencidir.. Videoda konuşmacı, pandemi döneminde disiplinsiz bir yaşam tarzı sürdürmesinin kendisine verdiği stresi anlatarak, yeni bir günlük rutin hazırladığını paylaşıyor. Bu rutin arasında sosyal medya saat sınırlaması (17:00-21:00 arası), sabah erken kalkma, namaz kılma, Kur'an okuma, haftada iki kez dışarı çıkma ve gece 23:00'de yatma gibi kurallar yer alıyor. Video, konuşmacının buzlu kahve yapması ve çilek kreması hazırlama süreciyle devam ediyor.
Big data refers to large, unmanageable amounts of data exceeding traditional storage limits. Digital universe grew from 130 exabytes in 2005 to 40,000 by 2020. Healthcare generates massive amounts of data from various sources
Biyoinformatik, bilgisayar bilimlerini biyoloji ve tıpla birleştiren bir alandır. İlaç keşfi, bilimsel verilerden ilaç etkin madde adaylarının saptanmasıdır. Genomik ve proteomik, biyoinformatiğin en önemli iki dalıdır
Bu video, bir doktora öğrencisinin Şili'de Niloi Santiago'da yaptığı moleküler biyoloji ve biyoinformatik staj deneyimini anlattığı bir vlog formatındadır.. Video, konuşmacının Şili'ye nasıl geldiğini, Arjantin-Şili sınırındaki bir volkanın asidik ortamlarında yaşayan bakterileri toplama görevini ve laboratuvar çalışmalarını anlatıyor. Staj sürecinde DNA, proteinler ve metagenomics gibi moleküler biyoloji konuları öğrenilirken, biyoinformatik'in moleküler biyolojinin olmazsa olmazı olduğu vurgulanıyor.. Konuşmacı ayrıca staj deneyiminin farklı bakış açıları ve metotlar sunarak vizyonunu genişlettiğini, kültür açısından da önemli olduğunu belirtiyor ve lisans öğrencilerine bu alanda bilgi edinmelerini tavsiye ediyor.
Ahi Evran Üniversitesi'nde Biyoinformatik Eğitimi sertifikası almıştır. İki yabancı dil bilmektedir
DVM, eğitim verilerindeki en uzak iki sınıf arasında karar sınırı bulan vektör uzayı tabanlı yöntemdir. 1992'de Vapnik ve Chervonenkis tarafından geliştirilmiştir. Başlangıçta doğrusal sınıflandırıcı olarak tasarlanmış, sonra kernel yöntemleriyle genişletilmiştir
Bu video, proteinlerin üç boyutlu homoloji modellemesini yapmak için Pierto web sitesinin kullanımını adım adım gösteren bir eğitim içeriğidir.. Video, Pierto web sitesinin tanıtımıyla başlayıp, protein homoloji modellemesi için gerekli dosyaların nasıl yükleneceğini, arayüzün nasıl kullanılacağını ve sonuçların nasıl indirileceğini detaylı şekilde anlatmaktadır. Ayrıca normal ve intensive mod seçenekleri arasındaki farklar açıklanmakta ve sonuçların yorumlanması için temel bilgiler verilmektedir. Video, biyoinformatik alanında protein modellemesi yapmak isteyenler için pratik bir rehber niteliğindedir.
Bu video, Sakarya Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği 1. sınıf öğrencisi Şule Koç ve Alihan adlı bir kişinin yer aldığı bilgilendirici bir sunumdur.. Sunum, biyoinformatikin tanımı, tarihçesi ve temel amaçlarıyla başlayıp, uygulama alanlarını (homologları bulma, gen ekspresyon analizi, protein modelleme, karşılaştırmalı genomik, kanser araştırmaları) detaylı şekilde ele almaktadır. Ardından biyolojik veri bankaları tanıtılmakta ve COVID-19, meme kanseri gibi güncel biyoinformatik çalışmaları paylaşılmaktadır. Son bölümde ise sağlık bilişim alanında eğitim imkanları ve Mavi Durak adlı yazılım topluluğu hakkında bilgiler verilmektedir.. Sunumda ayrıca Türkiye'de Kadir Has Üniversitesi'nde biyoenformatik ve genetik alanında yüksek lisans ve doktora programları bulunduğu belirtilmekte ve Mavi Durak topluluğunun Sakarya Üniversitesi'nde faaliyet gösteren, mentorluk ekibi olan ve her cuma günü toplantılar düzenleyen bir bilişim topluluğu olduğu açıklanmaktadır.
Bu video, Melike Türkoğlu tarafından sunulan eğitici bir içeriktir. Konuşmacı, biyoinformatik kavramını ve kullanım alanlarını açıklamaktadır.. Video, biyoinformatikin tanımı ile başlayıp, interdisipliner bir bilim dalı olduğunu vurgulamaktadır. Ardından biyoinformatik araştırmalarının üç temel amacı (verileri yorumlama, araçlar geliştirme, verileri organize etme) anlatılmaktadır. Daha sonra biyoinformatikin en çok kullanıldığı tıp sektöründe uygulamaları ve veri işleme süreci açıklanmaktadır. Video, biyoinformatikin günlük hayattaki kullanımını gösteren bir örnek videosu izlenmesiyle sonlanmaktadır.
I-Mutant2.0 predicts protein stability changes upon single-site mutations. Tool trained on ProTherm database, most comprehensive protein mutation database. Predicts stability change from structure (80%) or sequence (77%)
Bu video, Ekotürk kanalında yayınlanan "Gün Ortası" programının bir bölümü olup, sunucu Naz Özdeğirmenci ile Hacettepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Biyoinformatik Ana Bilim Dalı öğretim üyesi Dr. İdil Yet arasında geçen bir röportajdır. Dr. İdil Yet, Loreal Türkiye ve UNESCO Türkiye Milli Komisyonu işbirliğinde hayata geçirilen "Bilim Kadınları İçin" programı kapsamında ödül almaya hak kazanan genç bilim insanlarından biridir.. Röportajda biyoinformatik alanının ne olduğu, çalışma alanları ve Türkiye'deki durumu ele alınmaktadır. Dr. Yet, biyoinformatik bölümünün biyoloji, tıp, sağlık, bilgisayar mühendisliği ve istatistik alanlarının birleşmesi olduğunu açıklayarak, karaciğer kanseri üzerine yaptığı araştırmaları ve omiklerin birleştirilmesi için yapay zeka ve makine öğrenmesi yöntemlerini anlatmaktadır.. Ayrıca röportajda biyoinformatik bölümünün yeni nesil öğrencilerdeki popülerliği, pandemi dönemindeki talep artışları, Türkiye'deki biyoinformatik çalışmalarının İngiltere'deki çalışmalarla karşılaştırması, kadın bilim insanlarının yaşadığı zorluklar ve gelecekteki dünya vizyonu gibi konular da tartışılmaktadır. Naz Hanım, pandemi döneminde online eğitim uygulamaları, finansman sorunları ve TÜBİTAK gibi kurumların desteği hakkında bilgiler vermektedir.
Bu video, Florida Üniversitesi Bilgisayar Bölümü'nde 2004 yılından beri hocalık yapan Taner Kahveci tarafından sunulan bir ders tanıtımıdır. Taner Kahveci, Kaliforniya Üniversitesi'nde doktora yapmış ve Türkiye'de Bilkent Üniversitesi Bilgisayar Bölümü'nde lisans eğitimi almıştır.. Video, bioinformatik (üniformatik) dersinin tanıtımını yaparak başlıyor ve ardından bioinformatikteki temel kavramları (filojeni, protein yapıları, biyolojik ağlar) açıklıyor. Daha sonra biyolojik verilerin çeşitliliği, büyüklüğü ve analiz edilmesinin zorlukları ele alınıyor. Son bölümde ise veri toplama ve algoritmalar konuları Pony Express örneği üzerinden anlatılıyor.. Ders, farklı altyapılarda yetişmiş öğrencilerin (mühendislik, biyoloji, tıp fakültesinden) katıldığı bir ders olup, temel biyoloji ve bilgisayar bilgisi varsayımı altında anlatılacaktır. Video, bioinformatik alanının bilgisayarcılar için önemli bir alan olduğunu vurgulayarak sona ermektedir.
Bu video, Yıldız Teknik Üniversitesi ve Gebze Teknik Üniversitesi'nden Moleküler Biyoloji ve Genetik (MBG) bölümünden öğrenciler ve bölüm başkan yardımcısı ile yapılan bir bilgilendirme oturumunu içermektedir. Konuşmacılar arasında özellikle Anıl adında bir dördüncü sınıf öğrenci bulunmaktadır.. Video, MBG bölümünün özellikleri, tıp bölümüyle arasındaki farklar, laboratuvar imkanları, ders içerikleri ve bölümün mühendislik değil biyoloji eğitimi sunduğu konularını ele almaktadır. Ayrıca bölümdeki öğrencilerin fizik-matematik derslerindeki zorlukları, İngilizce adaptasyon süreci, staj imkanları, Erasmus programı ve mezuniyet sonrası iş fırsatları hakkında bilgiler verilmektedir.. Videoda ayrıca biyoinformatik ve yazılım konularının biyoloji alanındaki önemi, Python programlama dilinin öğrenilmesi ve bilim kulübü faaliyetleri hakkında bilgiler de paylaşılmaktadır. Konuşmacılar, bölümün avantajları ve dezavantajlarını, laboratuvar imkanlarını ve hocalarla iletişim sürecini de detaylı olarak anlatmaktadır.
Bu video, bilimsel araştırmaları ve bulguları aktaran bilgilendirici bir içeriktir. İspanyol Ulusal Kanser Araştırmaları Merkezi, Madrid Hayvanat Bahçesi Akvaryumu, Barcelona Üniversitesi ve İsviçre Biyoinformatik Enstitüsü gibi kurumların araştırmacıları tarafından yapılan çalışmalar ele alınmaktadır.. Video, canlıların yaşam sürelerinin neden farklı olduğunu açıklamaktadır. İlk bölümde telomer kısalma hızının türlerin yaşam süresine etkisi incelenirken, ikinci bölümde İsviçre Biyoinformatik Enstitüsü'nden Dr. Zoltan Kutalik ve ekibinin insan ömrüyle bağlantılı genetik varyantları araştırması anlatılmaktadır. Son bölümde ise okyanuslarda yaşayan ölümsüz denizanalarının gençleşme süreci ve bunun insanlara uygulanabilirliği hakkında bilgiler verilmektedir.