Mikrobiyoloji

Laboratuvar tipi derin dondurucular, birçok biyolojik materyalin uzun süre saklanması, korunması ve depolanması amacıyla kullanılır. Bazı kullanım alanları: Mikrobiyoloji ve arge laboratuvarları. Hastaneler. İlaç, gıda ve kimya sektörleri. Veterinerlik, biyoloji ve eczacılık bölümleri. Ayrıca, metallerin düşük sıcaklıklarda büzülmesini sağlamak gibi farklı test ve işlemlerde de kullanılabilir.

Bakterilerin diğer adı monera alemini oluşturan prokaryot canlılardır. Ayrıca, bakteriler için kullanılan bazı özel terimler de vardır: Bacterium: Bakterilerin tekil adıdır. Coccus (kokus): Küresel şekilli bakteriler için kullanılır. Basil: Çubuksu şekilli bakteriler için kullanılır. Spirillum, spiroket ve vibrio: Sarmal veya virgül şeklinde olan bakteriler için kullanılır.

Biyogüvenlik kabini, biyolojik koruma sağlamak amacıyla kullanılır ve şu işlevleri yerine getirir: Personel koruması: Kabin, laboratuvar çalışanını patojenlerden korur. Çevre koruması: Zararlı bakteri ve virüsleri içeren atık havayı filtreleyerek çevreye yayılmasını engeller. Ürün koruması: Bazı biyogüvenlik kabini türleri, çalışılan materyalleri de korur. Biyogüvenlik kabinleri, ilaç sektörü, gıda sektörü, çevre sektörü gibi çeşitli alanlarda kullanılır.

Azot döngüsü sırasında serbest azot, denitrifikasyon aşamasında açığa çıkar. Denitrifikasyon, topraktaki nitrat (NO₃⁻) ve amonyumun (NH₄⁺) nitroz oksit (N₂O) ve serbest azot gazı (N₂) şekline dönüştürülmesi sürecidir.

Erwinia amylovora bakterisinin bazı vektörleri: Böcekler. İnsanlar.

Bakterilerin DNA yapısı şu özelliklere sahiptir: Çembersel (sirküler) yapı: Bakteriyel DNA, genellikle çift zincirli ve çembersel (bazı bakterilerde lineer) bir yapıya sahiptir. Çift iplikçik: DNA molekülü, iki polinükleotid iplikçiğin sarmal şeklinde bağlanmasıyla oluşur. Uzunluk: Bakterinin türüne bağlı olarak değişmekle birlikte, örneğin E. coli'de DNA uzunluğu 1.2-1.5 mm olup, 4x10⁶ baz çiftinden oluşur ve bu uzunluk, bakteri uzunluğunun yaklaşık 500 katı kadardır. Bileşenler: DNA'nın yapısında pürin (adenin, guanin) veya pirimidin (sitozin, timin) bazları, 5 karbonlu pentoz şekeri (2-deoksi-D-riboz) ve fosfat molekülü bulunur. Hidrojen bağları: Bir iplikçikte bulunan pirimidin bazları (timin, sitozin), diğer iplikçikte bulunan pürin bazları (adenin, guanin) ile hidrojen bağları oluşturarak birleşir. Genetik bilgi: DNA, hücrenin yaşamını sürdürebilmesi için gerekli olan tüm genetik bilgiyi içerir ve genler adı verilen bölümler tarafından kodlanan proteinlerin sentezini yönlendirir.

Mikrobiyolojide ilk keşif olarak kabul edilen olay, Antony van Leeuwenhoek'un 1676 yılında kendi tasarladığı tek lensli mikroskopla bakterileri ve diğer mikroorganizmaları gözlemlemesidir. Bu keşif, mikrobiyolojinin kurucusu olarak da bilinen Leeuwenhoek'a "mikrobiyolojinin babası" unvanını kazandırmıştır. Ancak, mikroorganizmaların gözlenmesine dair ilk kayıt, sanıldığının aksine Leeuwenhoek'a değil, Robert Hooke'a aittir. Ayrıca, Athanasius Kircher adındaki bir cizvit rahibinin de mikroorganizmaları ilk kez gözlemleyen kişi olduğu söylenmektedir.

Lipopolisakkarit (LPS), gram-negatif bakterilerde bulunur. Bazı gram-negatif bakteri örnekleri: Escherichia coli; Salmonella enterica; Vibrio cholerae; Yersinia pestis; Brucella abortus. Ayrıca, Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae ve Bordetella pertussis gibi bazı patojenler de LPS içerir, ancak bu bakterilerde O-zinciri bulunmaz ve bu nedenle lipooligosakkarit (LOS) olarak adlandırılır.

Türk Gıda Kodeksi Mikrobiyolojik Kriterler Yönetmeliği'ne göre mikrobiyolojik açıdan riskli kabul edilen gıdalar arasında şunlar bulunmaktadır: Tüketime hazır gıdalar. Kurutulmuş bebek formülleri ve özel tıbbi amaçlı kurutulmuş gıdalar. Et ve et ürünleri. Balıkçılık ürünleri. Tatlılar ve şekerli ürünler. Bu gıdalar, belirli mikrobiyolojik kriterleri karşılamadıklarında piyasaya arz edilemezler.

Ekzotoksin ve endotoksin, mikroorganizmalar tarafından salgılanan zehirli maddelerdir (toksinler). Ekzotoksinlerin özellikleri: Kaynağı: Ağır metaller, endüstriyel maddeler, biyolojik toksinler, tarım ilaçları, böcek ilaçları, küfler, gıda katkı maddeleri gibi çeşitli maddeler. Yapısı: Protein karakterindedir. Isıya dayanıklılık: Genellikle ısıya duyarlıdır (termolabil). Etki şekli: Vücutta etkiledikleri doku veya organlara göre nörotoksinler, enterotoksinler ve sitotoksinler olarak sınıflandırılır. Endotoksinlerin özellikleri: Kaynağı: Bakteriyel parçalanma sonrası ortaya çıkar. Yapısı: Lipopolisakkarit yapısındadır. Isıya dayanıklılık: Isıya ve bazı enzimlere karşı dirençlidir (termostabil). Etki şekli: Ateş, solunum güçlüğü, ishal ve bacak felci gibi etkilere neden olur.

Evet, mantarlar ve bakterilerin bir kısmı saprofittir. Saprofitler, ölü bitki ve hayvan atıkları ile birlikte diğer organik atıkların üzerine sindirim enzimleri salgılayarak bu maddeleri parçalayan ve ihtiyaç duydukları organik maddeleri hücrelerine alan canlılardır. Bazı saprofit mantar ve bakteri örnekleri: küf mantarları; çürükçül mantarlar; trüf mantarları; azot fiksasyonu yapabilen bakteriler; güve larvaları; çekirge larvaları; toprak solucanları.

Tıbbi mikrobiyoloji ve klinik mikrobiyoloji aynı değildir, ancak birbiriyle yakından ilişkili iki farklı uzmanlık alanını ifade eder. Tıbbi mikrobiyoloji, mikroorganizmaların insan vücudu üzerindeki etkilerini ve enfeksiyonların biyolojik mekanizmalarını inceleyen daha geniş bir alandır. Klinik mikrobiyoloji ise, hastalıklara neden olan mikroorganizmaların tanımlanması, teşhis edilmesi ve tedavi yöntemlerinin geliştirilmesiyle ilgilenir. Her iki alan da enfeksiyon hastalıklarıyla mücadele, tanı ve tedavi yöntemlerinin geliştirilmesi konularında kritik bir öneme sahiptir.

Botulizm, Clostridium botulinum bakterisinin ürettiği toksinden kaynaklanır ve bu bakteri, 85°C'den yüksek sıcaklıklarda 5 dakika kaynatıldığında ölür. Ancak, toksin ısıya çok dayanıklı değildir ve 80°C'de 10 dakika veya daha fazla sürede ısıtma ile yok edilebilir. Sporların tamamen yok edilmesi için ise gıdaların en az 120°C sıcaklıkta kaynatılması gerekir.

Genel Mikrobiyoloji I dersinde işlenen bazı konular: Mikrobiyolojiye giriş. Mikroorganizmaların genel özellikleri. Prokaryotik ve ökaryotik mikroorganizmalar. Mikroorganizmalarda beslenme ve gelişme. Mikroorganizmalarda çoğalma. Mikrobiyal metabolizma ve enerji üretimi. Mikroorganizmaların doğada yayılışı. Birbirleri ve diğer canlılar ile ilişkileri. Zararlı ve yararlı etkileri. Mikroorganizmaların isimlendirilmeleri ve sınıflandırılmaları. Ders içeriği, üniversiteye ve eğitim programına göre değişiklik gösterebilir.

Bakteriler, en çok 20-45 °C arasındaki sıcaklıklarda yaşarlar. Bakteriler, sıcaklık toleranslarına göre üç ana gruba ayrılır: 1. Psikrofilik (soğuk seven) bakteriler: 0 °C ile 20 °C arasında en iyi gelişim gösterirler. 2. Mezofilik (ılık seven) bakteriler: 20-45 °C arasında en iyi gelişim gösterirler. 3. Termofilik (sıcak seven) bakteriler: 45-80 °C arasında en iyi gelişim gösterirler. Ayrıca, bakteriler için en uygun sıcaklıklardan biri 37 °C'dir; bu sıcaklıkta hızlı bir şekilde çoğalırlar.

Koagulaz pozitif bakteriler, genellikle Staphylococcus cinsine aittir ve bu türler arasında: Staphylococcus aureus; Staphylococcus intermedius; Staphylococcus hyicus bulunur. Bu bakteriler, insan ve hayvanlarda hastalıklara yol açabilen patojenik mikroorganizmalardır.

Mikrobiyal kontrolde kullanılan bazı fiziksel yöntemler: Isıl işlemler: Kuru ısı. Nemli ısı (basınçlı buhar). Pastörizasyon. Soğutma ve dondurma. Işınlama. Filtrasyon. Yakma.

MacConkey agar, gram-negatif ve enterik (bağırsakta normalde bulunan) mikroorganizmaları seçer. Bu agar, gram-pozitif organizmaların büyümesini, içinde bulunan kristal violet ve safra tuzları ile inhibe eder. MacConkey agar ile seçilen bazı mikroorganizma örnekleri: Escherichia coli; Enterobacter ve Klebsiella türleri; Citrobacter türleri; Pseudomonas türleri. Ayrıca, MacConkey agar, laktoz fermente eden ve etmeyen gram-negatif çubuklar arasında kolonyal büyüme rengine göre ayrım yapar.

Pembe renkli bakterilerin hangi besiyerinde ürediğine dair bilgi bulunamamıştır. Ancak, bakterilerin ürediği bazı besiyerleri şunlardır: Adi agar. MacConkey agar. Baird Parker Agar. Bakterilerin hangi besiyerinde ürediğini belirlemek için bir mikrobiyoloji uzmanına danışılması önerilir.

Tıpta "kolonize" ve "kolonizasyon" terimleri farklı anlamlara sahiptir: Kolonizasyon, bir mikroorganizmanın konakta klinik bir hasar bırakmadan steril olmayan vücut bölgelerinde yerleşmesi ve çoğalması anlamına gelir. Kolonize, "sömürgeleştirilmiş" veya "işgal edilmiş" anlamında kullanılır. Ayrıca, "kolonizasyon" kelimesi, bir ülkenin başka bir ülke üzerinde egemenlik kurarak onun maddi ve manevi kaynaklarını kendi yararına kullanacak şekle getirmesi anlamında da kullanılır.