Mikrobiyoloji

Enfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi kitabı, 2 cilt takım halinde yayımlanmıştır.

Evet, hem Salmonella hem de Proteus türleri hidrojen sülfür (H2S) üretebilir.

Mikrobiyoloji, iyi bir kariyer seçeneği olabilir çünkü mikrobiyologlar, geniş bir istihdam alanına sahiptir ve çeşitli sektörlerde çalışma imkanı bulurlar. Mikrobiyologların çalışabileceği bazı alanlar: Araştırma ve geliştirme. Akademik kariyer. Klinik laboratuvar hizmetleri. Biyoteknoloji sektörü. Mikrobiyologların maaşı, deneyim ve çalıştıkları sektöre bağlı olarak değişiklik gösterir. Kariyer kararı verirken, kişisel ilgi alanları ve hedefler de göz önünde bulundurulmalıdır.

Siyanobakterilerin özellikleri şunlardır: 1. Prokaryotik Yapı: Tanımlanmış bir hücre çekirdeğine sahip olmayan prokaryotik hücrelerden oluşurlar. 2. Fotosentetik Yetenek: Oksijenli fotosentez yapabilirler, yani ışık enerjisini kimyasal enerjiye dönüştürürler. 3. Renk: Mavi-yeşil renktedirler, bu renk fikobilin adı verilen pigmentlerden kaynaklanır. 4. Boyut: Mikroskobik organizmalar olup, birkaç mikrometre uzunluğundadırlar. 5. Üreme: Eşeysiz olarak çoğalırlar (ikili bölünme, çoklu bölünme, tomurcuklanma veya parçalanma). 6. Ekolojik Çeşitlilik: Su ve karasal ekosistemlerde, ayrıca çöller, kaplıcalar, buzullar gibi aşırı ortamlarda da yaşayabilirler. 7. Simbiyotik İlişkiler: Eğrelti otları, protistler veya mantarlar ile simbiyotik ilişkiler kurabilirler. 8. Ekonomik Önem: Bazı türleri, besin takviyesi olarak kullanılan spirulina üretiminde kullanılır.

Temel mikrobiyoloji kitapları, mikroorganizmaların biyolojisi, çeşitliliği, ekolojisi ve tıbbi, endüstriyel uygulamalardaki rolü hakkında bilgi edinmek için kullanılır. Bu kitaplar, aşağıdaki alanlarda işe yarar: Tıp ve veterinerlik: Hastalıkların teşhisi, tedavisi ve önlenmesi için mikroorganizmaların özelliklerinin anlaşılması. Gıda endüstrisi: Gıda güvenliği, bozulma süreçleri ve hijyen konularında bilgi sağlama. Tarım: Toprak mikroorganizmalarının bitki büyümesi ve toprak verimliliği üzerindeki etkilerini inceleme. Çevre bilimi: Su ve toprak mikrobiyolojisi gibi çevresel etkileşimleri araştırma. Biyoteknoloji: Genetik mühendislik ve biyolojik ürünlerin üretimi gibi endüstriyel uygulamalarda mikroorganizmaların kullanımı.

Parazitoloji, genel mikrobiyolojinin alt dallarından biridir.

Stenotrofomonas maltofili (S. maltophilia) doğada yaygın olarak bulunan bir bakteridir ve aşağıdaki ortamlarda görülebilir: Toprak; Su; Kontamine tıbbi çözümler (salin durulama solüsyonları, nemlendirici suyu gibi); Kontamine tıbbi cihazlar (kateterler ve solunum tüpleri gibi). Ayrıca, insanların orofarinks ve balgamında da izole edilebilir.

Enterobacter ve Escherichia coli Enterobacteriaceae familyasına aittir.

Gazi Üniversitesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında aşağıdaki testler yapılmaktadır: 1. Bakteriyel Kültür Testleri: Mikroorganizmaların çoğalması ve tanınması için. 2. Viral Tanı Testleri: Viral enfeksiyonların teşhisinde, PCR, antijen testleri ve antikor testleri gibi. 3. Mantar Kültür Testleri: Mantar enfeksiyonlarının tanısında. 4. Parazitolojik Testler: Dışkı, idrar, kan veya doku örneklerinin incelenmesiyle parazit enfeksiyonlarının teşhisinde. 5. Antibiyotik Duyarlılık Testleri: Bakterilerin antibiyotiklere duyarlılığını belirlemek için. 6. Serolojik Testler: Kanda mikroorganizmalara karşı oluşan antikorların veya antijenlerin tespiti.

Stafilokoklar, hemolizini dört ana toksin aracılığıyla gerçekleştirir: alfa, beta, delta ve gama toksinleri. Bu toksinler, hemolitik etkinlik göstererek kolonilerin çevresindeki alyuvarları eritir ve bir S-hemoliz bölgesi oluştururlar.

Kapsül, bakteriye çeşitli avantajlar sağlar: 1. Fagositoza Karşı Koruma: Kapsül, bakterinin bağışıklık sisteminin hücreleri tarafından tanınmasını ve yok edilmesini zorlaştırır. 2. Kuruma ve Çevresel Şartlara Karşı Koruma: Kapsül, bakteriyi kuruma, kimyasallar ve diğer zararlı çevresel etmenlere karşı korur. 3. Antijenik Özellik: Bakteriye antijenik özellik kazandırarak, vücudun savunma mekanizmasını harekete geçirir. 4. Deterjan ve Faj Gibi Maddelere Karşı Engel: Kapsül, deterjanlar gibi hidrofobik maddelerin ve fajların bakteriye ulaşmasını engeller.

Mantarlar ve saprofitler arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Beslenme Şekli: Mantarlar heterotrof olup, kendi besinlerini sentezleyemezler ve diğer canlılar tarafından hazırlanmış organik besinleri kullanırlar. 2. Hücre Duvarı Yapısı: Mantarların hücre duvarında kitin ve glukan gibi kompleks karbonhidratlar bulunurken, saprofitlerin hücre duvarı genellikle sadece selüloz içerir. 3. Üreme: Mantarlar hem eşeyli hem de eşeysiz üreme yapabilirken, saprofitler sadece eşeysiz üreme yoluyla çoğalır. 4. Ekolojik Rol: Mantarlar, ekosistemdeki enerji döngülerinin düzenleyicileri olarak görev yapar ve fermantasyon endüstrisinin temelini oluşturur.

Flagella boyaması ile bakterilerin hareket organı olan flagellaların varlığı muayene edilir.

PYR kart testi, Streptococcus pyogenes (A grubu strep), Enterococcus spp., bazı koagülaz-negatif stafilokoklar ve D grubu enterokoklar gibi spesifik bakterilerdeki pyrolidonyl arylamidase aktivitesinin tespit edilmesinde kullanılan bir testtir. Bu test, bakterilerin tanımlanması ve ayırt edilmesi için hızlı ve güvenilir bir yöntem sağlar.

Evet, putrefaksiyon ve çürüme aynı şeyi ifade eder. Putrefaksiyon, organik bir maddenin bakteri ve funguslar aracılığıyla anaerobik parçalanması olarak tanımlanır.

Virüs ve mikrop arasındaki fark şu şekilde özetlenebilir: - Mikrop, hastalığa neden olabilecek mikroskobik bakteri, virüs, mantar ve protozoa anlamına gelir. - Virüs, bakterilerden daha küçük, cansız bir parazittir ve üremek için başka bir hücrenin yapılarını kullanmak zorundadır. Dolayısıyla, tüm virüsler mikrop olarak kabul edilirken, tüm mikroplar virüs değildir.

İnkübasyon sonucu gözlemlemek için aşağıdaki yöntemler kullanılır: 1. Mikrobiyoloji Laboratuvarında: İnkübasyon, mikroorganizmaların üremesi için uygun sıcaklık, nem, oksijen ve gaz atmosferinin sağlandığı inkübatörlerde yapılır. 2. Otomatik Kan Kültür Cihazlarında: Bu cihazlarda inkübasyon süreci, bilgisayar ekranında takip edilir ve üreme uyarısı veren besiyerleri barkod okuyucuya okutularak inkübasyondan çıkarılır. 3. EMS Yönteminde (En Muhtemel Sayı): Bu yöntemde, içinde besiyeri içeren test tüplerinin içerisine küçük Durham tüpleri yerleştirilir ve inkübasyon sonucunda bu tüplerin içerisinde gaz çıkışı olup olmadığı gözlemlenir.

Endüstriyel mikrobiyoloji final konuları genellikle aşağıdaki başlıkları içerir: 1. Mikrobiyal Metabolizma: Mikroorganizmaların metabolik aktiviteleri ve ürünleri. 2. Endüstriyel Mikroorganizmalar: Fermentasyonda kullanılan mikroorganizmalar ve rekombinant DNA teknolojisi. 3. Fermentasyon Besiyeri ve Sistemleri: Fermentasyon ortamları ve fermentör çeşitleri. 4. Fermentasyon Sonrası İşlemler: Ürün geliştirme, düzenleme ve güvenlik. 5. Endüstriyel Ürünler: Mikrobiyal enzimler, yakıtlar, kimyasallar, gıdalar ve içecekler. 6. Çevre Biyoteknolojisi: Mikroorganizmaların çevre arıtımında kullanımı.

E. coli bakterisi, genel üretim besiyerleri olarak adlandırılan pepton suyu, et suyu ve jeloz gibi ortamlarda ürer.

Prof. Dr. Halit Özsüt, İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi'nde Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji ana bilim dalında çalışmaktadır.