EBYS (Elektronik Belge Yönetim Sistemi) Marmara'da şu adımlarla kullanılır: 1. EBYS ana ekranına giriş yapılır. 2. Evrak işlemlerinden "Evrak Oluştur" seçeneğine tıklanır. 3. Sırasıyla Konu Kodu, Konu, Kaldırılacak Klasörler, Miat, Gereği Seçim Tipi, Gereği alanları doldurulur. 4. Editör alanında resmi yazı yazılır. 5. Varsa ek kısmı yazılır ve dosya eklenir, ilgi kısmı doldurulur. 6. Kaydet ve Onaya Sun seçenekleri seçilir. 7. Onay yetkilisi olan kurum müdürü tarafından e-imza ile imzalanan yazı, gönderileceği kuruma iletilir. EBYS'nin kullanımı, kullanıcıların yetkilendirilme biçimlerine göre değişiklik gösterebilir.