GvHD (graft-versus-host hastalığı) çeşitli organları etkileyebilir: Cilt: Döküntü, kızarıklık, kaşıntı. Gastrointestinal sistem: Mide bulantısı, kusma, ishal, karın ağrısı, kilo kaybı. Karaciğer: Bilirubin seviyesinde artış. Akciğerler: İltihaplanma, skar oluşumu, nefes darlığı. Ağız ve gözler: Kuruluk, ağrılı yaralar, hassasiyet. Eklemler ve kaslar: Sertlik, ağrı, hareket kısıtlılığı. Vajina: Ağrı, scarring, cinsel ilişki sırasında zorluk. GvHD, genellikle birden fazla organı aynı anda etkiler.