Kolorektal cerrahi, kalın bağırsak (kolon), rektum ve makat bölgesi hastalıklarının tedavisinde uzmanlaşmıştır. Bu cerrahi dalın ilgilendiği bazı hastalıklar şunlardır: Kanser ve polipler: Kolon kanseri, rektal kanser, anal kanser, peritoneal karsinomatozis. İltihabi bağırsak hastalıkları: Ülseratif kolit, Crohn hastalığı. Yapısal kusurlar: Kalın bağırsak tıkanıklıkları, anal fistül, rektovajinal fistül, pelvik organ prolapsusu, rektal prolapsus. İyi huylu koşullar: Gastrointestinal kanama, anal fissür, hemoroid, rektal ülserler, kabızlık. Kolorektal cerrahi, hastalığın evresine ve şiddetine bağlı olarak farklı yöntemlerle uygulanır.