Mikrobiyoloji

Bakteri görsellerine ulaşabileceğiniz bazı kaynaklar: istockphoto.com. pixabay.com. shutterstock.com. creazilla.com. Ayrıca, Wikipedia'da bakteri görselleri içeren bir sayfa bulunmaktadır.

Petri kabı, mikrobiyolojik kültürlerin (bakteri, mantar, maya vb.) yetiştirilmesi için kullanılan, düşük ve geniş bir kap türüdür. Agar, deniz yosunlarından elde edilen bir jelleştirici maddedir ve besiyerleri katılaştırmak için kullanılır. Bazı özellikleri: Jelleştirici özellik: 32-40°C arasında jelleşir ve 85°C üzerinde erir. Kimyasal yapı: Polisakkaritlerden oluşur, besin değeri yoktur ve mikroorganizmalar tarafından tüketilmez. Kullanım alanları: Mikrobiyoloji: Mikrobiyolojik kültürlerin büyümesi için besiyerini katılaştırmak amacıyla kullanılır. Hücre kültürü: Bitki doku kültürlerinde ve diğer biyoteknolojik uygulamalarda da kullanılır.

İnkübatörde hangi bakterilerin yetiştirildiğine dair bilgi bulunamadı. Ancak, bakterilerin laboratuvar ortamında yetiştirilmesi hakkında genel bilgi mevcuttur. Bakteriler, inkübatörde şu koşullarda yetiştirilir: Besiyeri: Bakterilerin ihtiyacı olan besin maddelerini sağlayan katı (agar plakları) veya sıvı besiyerleri kullanılır. Sıcaklık: Çoğu bakteri için ideal sıcaklık 35-37°C arasındadır. İnkübasyon Süresi: Genellikle 24-48 saat arasında değişir. Sterilizasyon: Bulaşmayı önlemek için laboratuvar malzemeleri otoklavda sterilize edilir ve aseptik çalışma teknikleri uygulanır. Bakteriler, tıp, gıda, ilaç sanayi ve biyoteknoloji gibi birçok alanda yetiştirilir.

Kemosentetik bakteriler, inorganik maddeleri oksitleyerek besin üretir. Kemosentez süreci iki reaksiyon basamağından oluşur: 1. Kimyasal enerji kazanımı. 2. Besin sentezi. Örneğin, kükürt bakterileri H2S gibi kükürtlü bileşikleri oksitleyerek kimyasal enerji elde eder ve bu enerji ile CO2 ve H2O, glukoza dönüştürülür. Kemosentetik bakteriler, azot döngüsünün gerçekleşmesini sağlayarak doğadaki madde döngülerinde önemli bir rol oynar.

Et yiyen bakteri (nekrotizan fasiit), genellikle aşağıdaki yerlerde bulunur: Su: Deniz, göl ve ırmak gibi sularda, ayrıca nemli toprakta bulunabilir. İnsan vücudu: İnsanda boğaz, cilt veya dışkıda zararsız şekilde bulunup uygun koşullarda hastalık yapıcı hale gelebilir. Et yiyen bakterinin yaşadığı bazı türler şunlardır: Vibrio vulnificus: Ilık ve hafif tuzlu deniz sularında yaşar. Aeromonas hydrophila: Tatlı sularda bulunur. Clostridium türleri: Dokularda gaz oluşumuna yol açan enfeksiyonlara neden olabilir. Et yiyen bakteri, sağlıklı kişilerde nadir görülse de bağışıklık sistemi zayıf olanlarda daha kolay gelişebilir.

Gram pozitif mikroskopik morfoloji, bakterilerin mikroskop altında görüntülenmesi ve boyanarak incelenmesi sonucu elde edilen özelliklerdir. Gram pozitif bakterilerin mikroskopik morfolojisine dair bazı özellikler: Şekil: Kok (yuvarlak, küresel) veya basil (çubuk) şeklinde olabilirler. Boyut: Tıbbi önemi olan bakteriler genellikle 0,2 – 1,5 µm çapında ve 3 – 5 µm uzunluğundadır. Düzen: Hücrelerin diziliş şekli, belirli hücre organellerinin varlığı ve yapısı hakkında bilgi verir. Boyanma: Kristal viyole boyası ile mor renge boyanırlar. Gram boyama, bakterilerin "gram pozitif" ve "gram negatif" olarak ikiye ayrılmasını sağlar.

Yağ tutucu bakterisi, yağ birikintilerini biyolojik olarak parçalayarak çalışır. Çalışma prensibi: 1. Yağların Parçalanması: Bakteriler, oksijen ve enzimlerin yardımıyla yağları parçalar. 2. Yan Ürünlerin Tüketimi: Bakteriler, bu yan ürünleri de tüketerek karbondioksit ve suya dönüştürür. Bu süreç, kötü koku sorununu kaynağında yok eder ve yağlı kanalların, gider ve lavabo tıkanıklıklarının oluşmasını engeller. Yağ tutucu bakterisinin aktifleşmesi için genellikle Enzimax gibi bir katalizör enzim ile birlikte kullanılması önerilir.

Saf kültürün önemi şu şekilde özetlenebilir: Mikrobiyolojik çalışmalar: Bir organizmanın özelliklerinin belirlenmesi ve tanısının yapılabilmesi için saf kültür elde etmek gereklidir. Gıda sektörü: Yoğurt, peynir ve tereyağı gibi süt ürünlerinde istenen tat, aroma, yapı ve kalitenin sağlanması için saf kültür kullanılır. Enfeksiyon hastalıkları: Fermantasyon sürecinde açığa çıkan etken maddelerle, insan sağlığını tehdit eden enfeksiyon ve organik hastalık etmenlerinin faaliyetleri engellenir. Araştırma ve geliştirme: Saf kültür, yeni besiyerlerine ekilerek veya deney hayvanlarına nakledilerek pasajlama yapılabilir.

Mayalar, iki ana gruba ayrılır: 1. Hakiki (ascosporogenous) mayalar: Ascomycetes sınıfı funguslar içinde incelenir ve askospor adı verilen cinsel sporlar oluştururlar. 2. Yalancı mayalar: Tomurcuklanma şeklinde eşeysiz ürerler ve Candida, Torula gibi cinsleri içerir. Ayrıca, mayalar filogenetik çeşitlilikleri nedeniyle Ascomycota ve Basidiomycota olmak üzere iki farklı şube altında sınıflandırılır.

Otoliz ve putrefaksiyon ölüm sonrası vücutta meydana gelen iki farklı biyolojik süreçtir: 1. Otoliz: Hücre ve dokuların, içerdikleri enzimler ve sıvılar aracılığıyla yapılarının bozulmasıdır. 2. Putrefaksiyon (Kokuşma): Bakterilerin etkisiyle dokuların parçalanması, erimesi veya dekompozisyonudur. Özetle: - Otoliz: Hücrelerin kendi kendini sindirmesi. - Putrefaksiyon: Bakterilerin etkisiyle dokuların parçalanması ve çürümesi.

Murray Temel Tıbbi Mikrobiyoloji kitabı tek ciltten oluşmaktadır. Ancak, "Klinik Mikrobiyoloji - Murray" adlı eser 2 ciltten oluşmaktadır.

Enterobakteriler, oksidaz negatif ve oksidaz pozitif olarak ikiye ayrılır. Oksidaz negatif enterobakteriler arasında Enterobacteriaceae, Acinetobacter baumanii ve Stenotrophomonas maltophilia bulunur. Oksidaz pozitif enterobakteriler arasında ise Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia, Campylobacter jejuni ve Helicobacter pylori yer alır. Ayrıca, enterobakteriler laktoz fermentasyonuna göre de sınıflandırılabilir: Laktozu fermente edenler. Laktozu geç fermente edenler. Laktozu fermente etmeyenler.

"İnkübe edilen kültür nasıl değerlendirilir?" sorgusuna doğrudan bir yanıt bulunamamıştır. Ancak, genel kültür seviyesini artırmak için bazı yöntemler şunlardır: Kitap okumak. Belgesel ve podcast dinlemek. Müze ve sergi gezmek. Yeni bir dil öğrenmek. Seyahat etmek.

Rhizobiaceae bakterileri, toprakta bulunur. Bu bakteriler, özellikle baklagil bitkilerinin (Fabaceae) kök nodüllerinin içine yerleşerek azot fiksasyonu yaparlar. Rhizobia türleri, Alfa Proteobacteria sınıfında yer alır ve çoğunlukla Rhizobium, Bradyrhizobium, Sinorhizobium gibi cinslerde gruplanır.

Tümbüldek'teki suyun siyah olmasının nedeni çeşitli faktörlere bağlı olabilir: 1. Paslı Borular: Eski ve paslanmış borular, suyun içinde çözünen pas nedeniyle siyah bir görünüm oluşturabilir. 2. Su Arıtma Sistemleri: Evlerdeki su arıtma sistemlerinin filtrelerinin tıkanması veya arızalanması, suyun kalitesini etkileyerek siyah su akışına neden olabilir. 3. Toprak Altı Madencilik ve İnşaat Faaliyetleri: Bölgedeki madencilik ve inşaat çalışmaları, yer altı sularının kalitesini etkileyerek minerallerin ve diğer maddelerin suya karışmasına yol açabilir. 4. Su Kaynağındaki Kirlilik: Kirli su kaynakları, organik ve inorganik maddelerin suya karışmasına neden olarak siyah su akmasına sebep olabilir. 5. Bakteriyel ve Mikrobiyal Etkiler: Suyun içindeki bazı bakteriler ve mikroorganizmalar, suyun rengini etkileyebilir ve siyah görünmesine neden olabilir.

Özel sindirim enzimleriyle organik atıkları ayrıştıran bakteriler, saprofit (çürükçül veya ayrıştırıcı) beslenme biçimine sahiptir. Saprofit bakteriler, dış ortama salgıladıkları enzimlerle bitki ve hayvan ölülerini daha basit organik maddelere parçalayarak onların çürümesini sağlarlar.

Oxoid nutrient agar'ın kullanımı şu adımları içerir: 1. Hazırlık: 28 gram nutrient agar tozunu 1 litre distile suda çözün. 2. Sterilizasyon: Karışımı 121°C'de 15 dakika otoklavda sterilize edin. 3. Petriye Döküm: Sterilize edilen karışımı petri kaplarına dökün ve ortamın katılaşmasını bekleyin. Kullanım amaçları: Bakteri alt kültürü: Organizmaların alt kültürünü oluşturmak için kullanılır. Biyokimyasal ve serolojik testler: Bu testlerden önce izolasyon plakalarından alt kültürlerin saflığını kontrol etmek için kullanılır. Öğretim ve gösteri: Öğretim ve deneysel gösterimler için uygundur. Ekleme imkanı: Gerektiğinde %10'a kadar kan veya diğer biyolojik sıvıların eklenmesine olanak tanır.

Gram boyama işlemi, bakterilerin hücre duvarı yapısına göre sınıflandırılmasını sağlayan bir mikrobiyolojik tekniktir. İşte bu işlemin adımları: 1. Örnek Hazırlama: Bakteri örneği cam bir lam üzerine yayılır ve havada kurutulur. 2. Fiksasyon: Örnek, ısıtılarak sabitlenir; bu, bakterilerin lam üzerine yapışmasını sağlar. 3. Kristal Mor Ötesi Boyama: Örnek, kristal mor boyası ile boyanır ve 1-2 dakika bekletilir. 4. Yıkama: Boyama işleminden sonra, örnek su ile durulanır. 5. İyot Çözeltisi Ekleme: İyot çözeltisi eklenerek, boyanın bakterilerle kompleks oluşturması sağlanır. 6. Alkol ile Dekolorize Etme: Alkol veya asetona maruz bırakılarak, Gram negatif bakterilerin boyası çıkarılır. 7. Karmin Boyası ile Son Boyama: Son olarak, karşıt boyama için karmin (safranin) eklenir. Gram boyama sonucunda, Gram pozitif bakteriler mavi-mor renkte, Gram negatif bakteriler ise kırmızı-pembe renkte görünür.

Nitrifiye edici bakteriler, yani Nitrosomonas ve Nitrobacter türleri, toprakta ve suda bulunur. Ayrıca, amonyağın bolca bulunduğu lağımın döküldüğü bölgeler onlar için ideal yaşam alanlarıdır. Bu bakteriler, atık su arıtma tesislerinde de bulunur. Nitrifiye edici bakterilerin bulunduğu bazı alanlar şunlardır: süs balık göletleri; balık kuluçka havuzları; tropikal balık havuzları; çok sayıda ördek veya kaz bulunan göletler ve göller; tarımsal akıntıya yakın göletler ve göletler; yağmur suyu tutma havuzları; liç alanları; atık su arıtma tesisleri.

"Pas: canlı mikronizma yönünde boyama saptanmamıştır" ifadesi, paslı metal yüzeyde canlı mikroorganizmaların varlığına dair bir boyama veya tespit yapılmadığını ifade eder. Bu, paslı metalin sadece paslanma süreci ve fiziksel özellikleri açısından incelendiğini, ancak biyolojik kontaminasyon veya mikroorganizmaların varlığı açısından bir değerlendirme yapılmadığını gösterir. Pas, demir ve çelik gibi metallerin oksijen ve nemle reaksiyona girmesi sonucu oluşan bir korozyon türüdür ve genellikle kırmızımsı kahverengi bir tabaka şeklinde görülür. Daha fazla bilgi için pas temizleme ve boyama işlemleri hakkında uzman bir kimyager veya endüstri kimyasalları firmasına danışılması önerilir.