Kompleman aktivasyonu, kompleman sisteminin proteinlerinin, patojenlerin savunmayı güçlendirmek için aktive edilmesi sürecidir. Bu süreç üç ana yolla gerçekleşir: 1. Klasik yol: C1 kompleksinin, patojenlerin yüzeyindeki antijenlere bağlı antikorlara bağlanmasıyla tetiklenir. 2. Lektin yolu: Mannoz bağlayıcı lektin proteinlerinin patojenlere bağlanmasıyla başlar. 3. Alternatif yol: Kompleman proteinleri P, D ve B'nin, patojenlerin yüzeyinde bulunan spesifik moleküllerle etkileşime girmesiyle aktive edilir. Aktivasyon sürecinin sonunda, merkezi bir bileşen olan C3'ün C3a ve C3b'ye bölünmesi gerçekleşir ve bu, patojenlerin yok edilmesine yol açar.