E. coli bakterisi en çok aşağıdaki besinlerde bulunur: Et ve et ürünleri: Sığır ve koyun eti gibi hayvanlar, kesim sırasında mide ve bağırsaklarından gelen bakterilerle kontamine olabilir. Çiğ süt ve pastörize edilmemiş süt ürünleri: E. coli, süt ve bu sütten yapılan ürünlerde de bulunabilir. Yeşil yapraklı sebzeler: Özellikle ıspanak, marul gibi sebzeler, tarım alanlarında kontamine su kullanımı sonucu bakteriyi taşıyabilir. Hazır gıdalar: Tüketime hazır salatalar, dondurulmuş gıdalar, yengeç ve karides eti, yumurta gibi ürünler de E. coli riski taşır. Bu besinlerin yetersiz ısıl işleme tabi tutulması, enfeksiyonların meydana gelmesi için önemli bir kriterdir.