Menenjit aşısının yan etkileri genellikle hafif ve kısa sürelidir. Yaygın yan etkiler arasında aşı yapılan bölgede ağrı veya tahriş, baş ağrısı, yorgunluk hissi, kas ağrıları ve hafif ateş bulunur. Nadir durumlarda ise daha ciddi yan etkiler ortaya çıkabilir, bunlar arasında ciltte yaygın döküntü, yüzde ve boğazda şişme, nefes almada zorluk, şiddetli baş dönmesi veya bayılma yer alır. Bu tür belirtiler görüldüğünde derhal tıbbi yardım alınmalıdır. Menenjit aşısının yan etkileri ve süresi, kişinin genel sağlık durumu ve aşıya verdiği tepkiye bağlı olarak değişebilir. Kesin bilgi için bir sağlık uzmanına danışılması önerilir.