Büyük Kaçgun'un başlıca sebepleri şunlardır: Ekonomik sıkıntılar: Devlet, gelir artırmak için vergileri artırmış, bu da köylülerin topraklarını terk etmesine ve kasaba ile şehirlere göç etmesine yol açmıştır. Tımar sisteminin bozulması: Tımar sistemi, aile kurumu gibi kullanılmaya başlanmış ve bu durum, köylülerin daha fazla yük altında kalmasına neden olmuştur. Yerel yöneticilerin baskısı: Yerel yöneticiler, güç kullanarak halktan vergi toplamış, bu da köylülerin silahlanarak mücadele etmesine yol açmıştır. Celali isyanları: 16. ve 17. yüzyıllarda Osmanlı yönetimindeki Anadolu'da ekonomik, sosyal, askeri ve siyasi nedenlerle başlayan isyanlar, halkın güvenli bölgelere sığınmasına neden olmuştur. Bu olaylar sonucunda, Osmanlı'nın vergi gelirleri azalmış, tarımsal üretim düşmüş ve toplumsal düzen bozulmuştur.