Hidroponik sistemler, çalışma prensiplerine ve besin çözeltisinin uygulanma şekline göre çeşitli türlere ayrılır: 1. Destekleyici ortam kullanımına göre: - Sıvı sistemler: Bitki köklerini destekleyici katı ortam bulunmaz. - Agregat sistemler: Torf, hindistan cevizi lifi gibi organik maddeler, kum, ponza taşı gibi inorganik maddeler veya sentetik maddeler destekleyici ortam olarak kullanılır. 2. Besin çözeltisinin uygulanma şekline göre: - Açık sistem: Besin çözeltisi bitki köklerine bir kez verilir ve yeniden kullanılmaz. - Kapalı sistem: Fazla besin çözeltisi toplanarak sistemde tekrar dolaştırılır. Ayrıca, hidroponik sistemler su basma ve tahliye etme, damlama, aeroponik gibi spesifik tekniklere göre de sınıflandırılabilir.