Louis Pasteur, kuğu boyunlu şişeyi, bakterilerin tozlar üzerinde taşındığını ve canlıların kendiliğinden var olmak yerine, kendilerinden önceki canlılardan geldiklerini ispatlamak amacıyla kullanmıştır. Pasteur'ün deneyinin hipotezi, hiçbir canlının kendiliğinden, birdenbire var olamayacağını ve her zaman kendisinden önceki canlılardan gelmek zorunda olduğunu ispatlamaktı. Pasteur, kuğu boyunlu şişelerle et suyu kaynatmış, şişenin boynunun kırıldığı durumda mikroorganizmaların girdiğini gözlemlemiştir. Pasteur'ün kuğu boyunlu şişe kullanarak yaptığı deneyde şu adımlar izlenmiştir: İçine et suyu koyduğu iki adet kap almış ve bunlara kuğu boynu şeklinde birer boru takmıştır. Bu borunun özelliği, içeriye hava girişini sağlaması; ancak toz ve kirin girmesine engel olmasıdır. Kapların ikisini de başta iyice ısıtarak steril ve bakterisiz bir ortam sağlamıştır. Daha sonra iki kabı da bir süre bekletmiştir. İki kapta da hiçbir bakteri ya da canlı oluşumu gözlenmemiştir. Daha sonra, kaplardan birinin boynunu kırmış ve hava ve toz ile doğrudan temas edebilmesini sağlamıştır. Diğer kabı ise aynen bırakmıştır. İlk kapta bakteri oluşumu gözlenmiş; ancak ikinci kapta hiçbir canlı oluşmamıştır. Böylece Pasteur, bakterilerin tozlar üzerinde taşındığını ve canlıların kendiliğinden var olmak yerine, kendilerinden önceki canlılardan geldiklerini ispatlamıştır.