ΔΔCt yöntemi, qRT-PCR (gerçek zamanlı kantitatif ters transkriptaz polimeraz zincir reaksiyonu) tekniğinde, bir hedef genin farklı koşullar altındaki ekspresyon seviyelerini karşılaştırmak için kullanılır. ΔCt değeri, bir hedef genin (GOI) eşik değerine (Ct) ulaşma süresinin, bir referans gen (REF) ile farkıdır. ΔΔCt'nin pozitif olması, tedavi edilen grupta hedef genin ifadesinin daha yüksek olduğunu gösterir. ΔΔCt'nin negatif olması, tedavi edilen grupta hedef genin ifadesinin daha düşük olduğunu gösterir. ΔΔCt'nin sıfır olması, iki grup arasında ifade farkı olmadığını gösterir. ΔΔCt, aynı zamanda "2^(-ΔΔCt)" şeklinde de ifade edilebilir ve bu, kat değişimini (fold change) temsil eder.