PDB (Protein Data Bank) dosyalarında bulunan veriler şunlardır: 1. Atomik Koordinatlar: Moleküldeki her atomun X, Y ve Z koordinatları. 2. Amino Asit Dizisi: Proteindeki amino asitlerin dizilimi, her amino asit üç harfli bir kodla temsil edilir. 3. Bağlantı Bilgileri: Atomların nasıl bağlandığını gösteren detaylar, bağ türleri ve mesafeler. 4. İkincil Yapı Bilgileri: Proteinin yapısal elemanları (alfa heliksler, beta tabakalar) hakkında bilgiler. 5. Meta Veriler: Yapının belirlenme yöntemi (X-ışını kristalografisi, NMR), çözünürlük ve ilgili bilimsel literatüre referanslar. Ayrıca, PDB dosyaları ligandlar ve çözücü moleküller gibi ek bilgileri de içerebilir.