Midye baklavanın içinde şu malzemeler bulunur: Hamur: Buğday unu, yumurta, tuz ve su karışımı. İç harç: Antep fıstığı içi, sade yağ, kaymak (süt+irmik). Şerbet: Pancar şekeri, su ve limon suyu. Ayrıca, midye baklavada gluten, süt ve süt ürünleri, yumurta gibi alerjenler de yer alabilir.