Bursa İl Sağlık Müdürlüğü'nde aşağıdaki birimler bulunmaktadır: 1. Başkanlıklar: Personel Hizmetleri Başkanlığı, Eğitim Hizmetleri Birimi, Disiplin İşlemleri Birimi. 2. Hizmet Birimleri: Sağlık Bilgi Sistemleri Birimi, İdari Hizmetler Birimi, Mali Hizmetler Birimi. 3. Halk Sağlığı Hizmetleri Başkanlığı: İzleme, Değerlendirme ve İstatistik Birimi, Aile Hekimliği Birimi. 4. Acil Sağlık Hizmetleri Başkanlığı: Afetlerde Sağlık Hizmetleri Birimi, Acil Sağlık Hizmetleri Birimi. 5. Diğer Birimler: Ağız ve Diş Sağlığı Hizmetleri Birimi, Kamu Hastaneleri Hizmetleri Başkanlığı. Ayrıca, ilçe sağlık müdürlükleri ve toplum sağlığı merkezleri de Bursa İl Sağlık Müdürlüğü'nün bünyesinde yer almaktadır.