Bursa İl Sağlık Müdürlüğü'nde bulunan bazı birimler şunlardır: Başkanlıklar: Personel Hizmetleri Başkanlığı, Eğitim Hizmetleri Birimi, Disiplin İşlemleri Birimi, Sağlık Bilgi Sistemleri Birimi, İdari Hizmetler Birimi, Mali Hizmetler Birimi. Halk Sağlığı Hizmetleri Başkanlığı: İzleme, Değerlendirme ve İstatistik Birimi, Aile Hekimliği Birimi, Çevre Sağlığı Birimi, Bulaşıcı Hastalıklar Birimi, Toplum Sağlığı Birimi. Acil Sağlık Hizmetleri Başkanlığı: Afetlerde Sağlık Hizmetleri Birimi. Kamu Hastaneleri Hizmetleri Başkanlığı: Sağlık Bakım ve Hasta Hizmetleri Birimi, Verimlilik ve Kalite Yönetim Birimi, İstatistik, Analiz ve Raporlama Birimi. Diğer Birimler: Döner Sermaye Muhasebe Hizmetleri Birimi, İl Kalite Koordinatörlüğü, Hukuk ve Muhakemat Birimi, İnceleme ve Soruşturma Birimi, Hasta Hakları İl Koordinatörlüğü. Ayrıca, ilçe sağlık müdürlükleri ve toplum sağlığı merkezleri de Bursa İl Sağlık Müdürlüğü'ne bağlıdır.