Mikrobiyoloji

LJ besiyeri, Löwenstein-Jensen besiyeri olarak da bilinir, Mycobacterium türlerinin izolasyonu ve gelişimi için kullanılan katı bir besiyeridir. Bu besiyeri, klinik testlerde gliserol eklenerek hazırlanır ve mikobakterilerin üremesi için gerekli tüm besinleri içerir.

Gram + ve Gram - arasındaki fark, bakterilerin hücre duvarı yapısı ve gram boyama tekniğine verdikleri tepkiye dayanır. Gram + bakterilerin özellikleri: - Hücre duvarları kalın peptidoglikan tabakalarından oluşur. - Ultraviyole ve iyot karışımı içerdikleri için mavi-siyah ya da mor renk alırlar. - Teikoik ve lipoteikoik asit içerirler. Gram - bakterilerin özellikleri: - Hücre duvarları ince peptidoglikan tabakası ve dış lipid zarı içerir. - Kristal viyole boyayı tutmazlar, bunun yerine karşı boya eklenerek kırmızı-pembe renge boyanırlar. - Lipopolisakkarit (LPS) zarı ve porinler bulunur.

TUS Mikrobiyoloji dersinde altı ana konu bulunmaktadır: 1. Temel Mikrobiyoloji. 2. Bakteriyoloji. 3. Viroloji. 4. Mikoloji. 5. Parazitoloji. 6. İmmünoloji.

Elektrik üreten bazı bakteriler şunlardır: 1. Geobacter sulfurreducens: Toprakta ve suyun dibindeki anaerobik ortamlarda yaşar, organik maddeleri parçalarken elektronları dış ortamdaki iletken maddelere aktarabilir. 2. Shewanella oneidensis: Elektronları dışarı taşıyabilir ve bu özellik mikrobiyal yakıt hücrelerinde elektrik üretimi için kullanılır. 3. Rhodoferax ferrireducens: Şekerleri parçalayarak elektrik üretebilir. 4. Pseudomonas türleri: Bazı şartlarda elektriksel aktivite gösterebilir. Ayrıca, Escherichia coli (E. coli) gibi bakteriler de doğal bileşiklerden elektronları dışarı taşıyarak enerji üretebilir.

Nitrifiye edici bakteriler, azot döngüsünde önemli bir rol oynayan mikroorganizmalardır ve amonyak ve nitritleri nitratlara dönüştürürler. Bu süreç, nitrifikasyon olarak adlandırılır. Nitrifikasyon bakterilerinin yaptığı işler: - Toprak verimliliğini artırır: Bitkilerin kullanabileceği nitratların oluşumunu sağlayarak. - Su kalitesini iyileştirir: Su kaynaklarındaki amonyak seviyelerini düşürerek. - Ekosistem dengesini sağlar: Azot döngüsünün kritik bir bileşeni olarak, ekosistemlerdeki besin zincirlerini destekler.

Nitrifiye edici bakteriler, azot döngüsünde önemli bir rol oynayan mikroorganizmalardır ve amonyak ve nitritleri nitratlara dönüştürürler. Bu süreç, nitrifikasyon olarak adlandırılır. Nitrifikasyon bakterilerinin yaptığı işler: - Toprak verimliliğini artırır: Bitkilerin kullanabileceği nitratların oluşumunu sağlayarak. - Su kalitesini iyileştirir: Su kaynaklarındaki amonyak seviyelerini düşürerek. - Ekosistem dengesini sağlar: Azot döngüsünün kritik bir bileşeni olarak, ekosistemlerdeki besin zincirlerini destekler.

Elektrik akımı ile renk değiştiren bir bakteri türü yoktur. Ancak, elektriği soluyan bakteriler olarak bilinen bazı bakteri türleri vardır. Bu bakteriler, elektronları dışarıdaki metallere veya minerallere aktararak elektrik üretirler.

Petri tekniği, iki şekilde uygulanabilir: epoksi reçine petri ve mikrobiyolojik deney petri kabı olarak. 1. Epoksi Reçine Petri: - Malzemeler: Süper berrak epoksi reçine, alkol renkleri, pinata beyaz alkol mürekkebi, silikon kalıp. - Adımlar: 1. Reçineyi karıştırın ve kalıba dökün. 2. Reçineye alkol renklerini ve beyaz mürekkebi ekleyin, üç ila dört katman oluşturun. 3. Kalıbı oda sıcaklığında bırakarak reçinenin kürlenmesini bekleyin. 4. Kürlendikten sonra, reçineyi kalıptan çıkarın ve keskin kenarları zımpara kağıdı ile düzeltin. 5. Son olarak, küpe haline getirmek için halka ve kulak teli ekleyin. 2. Mikrobiyolojik Deney Petri Kabı: - Malzemeler: Petri kabı, agar agar tozu, su, besin kaynağı (et suyu veya şekerli su), pamuklu çubuk, mikroskop. - Adımlar: 1. Agar agar tozunu su ile karıştırarak kaynatın ve karışımı petri kabına dökün. 2. Soğuyup katılaşmasını bekleyin. 3. Katılaşan agarın üzerine besin kaynağını ekleyin. 4. Pamuklu çubuğu kullanarak evdeki farklı yüzeylerden örnekler alın. 5. Örnekleri petri kabındaki agarın üzerine sürün. 6. Petri kabını oda sıcaklığında birkaç gün bekletin ve her gün gözlem yapın.

bioMérieux, in vitro teşhis alanında faaliyet gösteren bir dünya lideridir. bioMérieux'nün yaptığı işler arasında: - Sözleşme üretimi ve klinik deneme desteği; - Ürün geliştirme ve analitik yöntem oluşturma; - Kalite kontrol testi ve düzenleyici uyumluluk danışmanlığı; - Endüstriyel mikrobiyoloji ve bulaşıcı hastalıklara yönelik teşhis sistemleri geliştirme.

Plazmid ve plazmodyum farklı kavramlardır: 1. Plazmid: Bakteri stoplazmalarında bulunan ve kromozom gibi davranan DNA molekülleridir. 2. Plazmodyum: Cıvık mantarların diploid evresini oluşturan çok çekirdekli amipsi hareket eden canlı madde kütlesi veya sıtmaya neden olan tek hücreli parazittir.

Uygun koşullarda, bir bakteri yaklaşık 10 saatte bir milyar kadar bireysel bakteriye çoğalabilir.

CFU (Colony Forming Unit), mikrobiyolojik bir terim olup, bir numunedeki canlı bakteri veya mantar hücrelerinin sayısını tahmin etmek için kullanılır. CFU ölçümleri şu alanlarda önemlidir: - Tıp: İdrar, kan ve yara örneklerinde bakteriyel enfeksiyonları tespit eder, antibiyotik direnç testlerinde kullanılır. - Gıda endüstrisi: Süt, et ve paketlenmiş gıdalardaki bakteriyel kontaminasyonu değerlendirir, probiyotik ürünlerin canlı bakteri içeriğini belirler. - Farmasötik ve biyoteknoloji: İlaç üretiminde steriliteyi sağlar, probiyotik ve aşı geliştirmede kullanılır. - Su ve çevre mikrobiyolojisi: Su kalitesini izler, atık su arıtma tesislerindeki mikrobiyal seviyeleri değerlendirir. CFU ölçümü, seyreltilmiş bir numunenin agar ortamına ekilmesi ve inkübasyon sonrası oluşan kolonilerin sayılmasıyla yapılır.

Bakteri izolasyonu, belirli bir ortamdan bakterilerin ayrıştırılması ve saf kültürlerin elde edilmesi sürecidir. Bu süreç genellikle aşağıdaki aşamalardan oluşur: 1. Örnek Toplama: İncelenecek materyalin (kan, doku, toprak, su vb.) uygun bir şekilde toplanması. 2. Kültür Ortamının Seçilmesi: İzolasyonda kullanılacak uygun besiyerinin hazırlanması veya seçilmesi. 3. İzole Etme: Örnekten bakteri hücrelerinin ayrıştırılması ve saf kültürün elde edilmesi. 4. İnceleme: Elde edilen kültürlerin mikroskopik ve biyokimyasal testlerle incelenmesi. Bakteri izolasyonu, hastalıkların teşhisi, aşı ve antibiyotik geliştirme, çevresel izleme ve biyoteknolojik uygulamalar gibi alanlarda kritik öneme sahiptir.

Nitrifikasyon, ortamda bulunan aerobik bakterilerin çeşitli formlarının azot, amonyum ve nitriti kullanarak kademe kademe nitrata dönüştürmesi sürecidir. Bu süreç, ölen canlıların proteinlerinin oksijenli ortamda mantar ve bakteri faaliyetleri ile amonyum iyonu, su ve karbondioksite kadar giden bir dizi ara basamakla yıkılması olarak da tanımlanabilir. Doğada bu işi Nitromonas ve Nitrobacter bakterileri yapar.

V. cholerae, ctxAB, tcp, toxR ve hap genlerinin varlığını tespit etmek için özel primerler kullanılarak PCR ile ayırt edilir.

İnkübasyon kaseti, mikroorganizmaların kültür ortamlarına ekildikten sonra çoğalmalarını sağlamak amacıyla kullanılan, sabit sıcaklık koşullarında tutulan bir kabindir. Bu kasetler, farklı tiplerde olabilir: soğutmalı, karbondioksitli, vakumlu gibi.

Pürüzlü koloniler, R (rough) koloni tipine aittir ve bu koloniler eski veya birçok kez pasaja maruz kalmış bakteri kültürleri tarafından oluşturulur.

Mytilus galloprovincialis türünden dondurulmuş midyeler, insan tüketimi için uygundur ve çeşitli amaçlarla kullanılabilir: 1. Gıda Endüstrisi: Dondurulmuş midyeler, restoran ve mutfaklarda çeşitli yemeklerin yapımında kullanılır. 2. Mikrobiyolojik Araştırmalar: Midyelerin dondurulmuş hali, mikrobiyolojik kalite ve güvenlik açısından incelenerek patojen bakterilerin varlığı araştırılır. 3. İhracat ve İthalat: Midyeler, işlenmiş gıda ürünleri olarak ihraç ve ithal edilir.

Pembe bakteri kolonisi, Gram (-) negatif bakteriler olarak adlandırılan ve mikroskopta pembe renkte görülen bakteri kolonilerini ifade eder.

Yunus Gürbüz, Ankara Dışkapı Yıldırım Beyazıt Eğitim ve Araştırma Hastanesi'nde enfeksiyon hastalıkları ve klinik mikrobiyoloji uzmanı olarak çalışmaktadır.