Eksozomlar çeşitli kaynaklardan elde edilebilir: Kültür ortamı: Mezenkimal kök hücrelerin kültür ortamında özel işlemler ile saflaştırılarak elde edilir. Vücut sıvıları: Kan, idrar, ağız içi salgı, amniyotik sıvı, beyin-omurilik sıvısı, eklem sıvısı, nazal salgılar, anne sütü, serum ve plazma gibi vücut sıvılarından da eksozomlar elde edilebilir. Doku kaynakları: Yenidoğan göbek bağı dokusu, deri ve yağ dokusu gibi kaynaklardan da eksozomlar elde edilebilir. Bitki ve hayvan kaynakları: Eksozomlar ayrıca inek sütü ve bitki gibi kaynaklardan da elde edilebilir, ancak bu kaynakların insan dokuları üzerindeki etkileri sınırlı veri ile desteklenmektedir.