Lipidler, yapı ve fonksiyonlarına göre üç ana gruba ayrılır: 1. Basit lipidler (sabunlaşamaz): Terpenler, steroller, mumlar, steroidler, prostaglandinler. 2. Kompleks lipidler (sabunlaşabilir): Fosfolipidler, sfingolipidler, glikolipidler, lipoproteinler. 3. Yağ asitleri: Doymuş yağ asitleri, doymamış yağ asitleri, hidroksi yağ asitleri, eikozanoidler. Bu sınıflandırma, lipidlerin kimyasal yapılarına ve içerdikleri bileşenlere dayanır.