Stoma, aşağıdaki durumlarda kapanır: 1. Karanlıkta: Stoma hücreleri karanlıkta fotosentez yapamaz, bu nedenle kapanır. 2. Sıcaklığın artması: Ortam sıcaklığının çok yükseldiği durumlarda su kaybını engellemek için stoma hücreleri kapanır. 3. Topraktaki su miktarının azalması: Bitki terlemeyle su kaybettiğinde, stoma hücrelerindeki turgor basıncı azalır ve stoma kapanır. 4. Absisik asit üretimi: Su azlığında, mezofil hücrelerinde üretilen absisik asit, stomaların kapanmasını sağlar.