Seperatörlerin çalışma prensibi, karışım içindeki farklı katmanları veya fazları ayırmak için kullanılan fiziksel yöntemlere dayanır. Bazı seperatör türlerinin çalışma prensipleri: Santrifüj seperatörler: Yüksek hızla dönen diskler sayesinde, yoğunluğu farklı olan sıvı ve katı partikülleri birbirinden ayırır. Eleme seperatörleri: Farklı boyutlardaki katı parçacıkları ayırmak için kullanılır. Filtre seperatörleri: Toz ve bakteri gibi daha küçük parçacıkları ayırmak için farklı gözenek boyutlarına sahip filtreler kullanır. Köpük seperatörleri: Yağ ve su gibi farklı yüzey gerilimine sahip sıvıları, hava kabarcıkları yardımıyla ayırır. Manyetik seperatörler: Manyetik katı maddeleri diğer katı maddelerden ayırır. Örnek olarak, seperatörün yağ ve yakıt ayrıştırma işlemi şu şekilde gerçekleşir: 1. Sıvı, pompası aracılığıyla filtreden geçirilir ve heaterden geçirilerek ısıtılır. 2. Akışkan, bowl disclerden geçer ve kendisinden daha ağır olan akışkanı disclerin deliklerinden uzak bir bölüme savurarak ayrıştırır.