Çocuklarda MR çekimi şu şekilde yapılır: 1. Hazırlık: Çekim öncesi çocuğun üzerindeki metal cisimler (gözlük, bilezik, küpe, kemer vb.) çıkarılır. 2. Pozisyon: Çocuk, yuvarlak bir mıknatısın içindeki boşluğa yatırılan hareketli bir masaya yerleştirilir. 3. İşlem: Manyetik alan çalıştırıldığında vücuda radyo dalgaları gönderilir ve yayılan enerji kaydedilir. 4. Hareketsizlik: Çekim sırasında çocuğun hareketsiz kalması gerekir; bu nedenle 7-8 yaş altı çocuklara sedasyon veya anestezi verilebilir. 5. Süre: Çekim süresi, vücudun hangi bölgesinin incelendiğine bağlı olarak 20-90 dakika arasında değişir. 6. Sonrası: Sedasyon veya anestezi uygulanmadıysa çocuk hemen ayrılabilir; kontrast madde verildiyse 10 dakika gözlem yapılır. MR çekimi, uzman bir radyolog tarafından değerlendirilecek görüntüler oluşturur.