Pandaların kafasının içinde, diğer ayı türlerinde olduğu gibi, beyin ve ilgili sinir sistemi yapıları bulunur. Ayrıca, pandaların kafatası ve çene yapıları, otçul bir diyete adapte olmalarını sağlayan bazı modifikasyonlara sahiptir: - Zamansal fossa genişlemiştir. - Elmacık kemiği büyütülmüştür, bu da masseter, elmacık ve mandibular kasların eklem yüzeyini artırır. Pandaların başparmak gibi görünen yapısı ise, aslında sesamoid kemiğinin değişmesiyle oluşmuş ve bambuları rahatça yemelerine yardımcı olan bir yapıdır.