Katmerin içine konabilecek malzemeler yöresine ve tarifine göre değişiklik gösterebilir: Klasik katmer: Genellikle un, su, tuz ve yağ gibi temel malzemelerle yapılır ve iç harcına ceviz, şeker veya pekmez eklenir. Gaziantep usulü katmer: İncecik açılan hamurun içine kaymak ve antep fıstığı konur. Sivas katmeri: Tuzlu bir lezzet için yaş maya, yumurta sarısı ve kaya tuzu kullanılır. Ayrıca, beyaz peynir gibi farklı malzemeler de katmerin iç harcında tercih edilebilir.