Toprak mikrobiyolojisi önemlidir çünkü: 1. Toprak Verimliliği: Topraktaki organizma faaliyetleri ve oluşturdukları reaksiyonlar, toprağın verimliliğini doğrudan etkiler. 2. Element Dönüşümü: Bitkilerin ihtiyaç duyduğu C, N, P, S gibi elementler, mikroorganizmalar vasıtasıyla yararlı şekle çevrilir. 3. Toprak Yapısı: Toprak mikroorganizmaları, toprak taneciklerinin bağlanmasına yardımcı olarak toprak yapısını iyileştirir, erozyonu önler ve nem tutulmasını artırır. 4. Ekosistem Dengesi: Toprak mikrobiyolojisi, ekosistemin kalitesini ve tarımsal ekosistemlerin verimliliğini korur.