Sabuncuoğlu Şerefeddin Amasya Devlet Hastanesi'nde aşağıdaki bölümler bulunmaktadır: Dahili Klinikler: Biyokimya, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları, Deri ve Zührevi Hastalıkları, İç Hastalıkları, Erişkin Ruh Sağlığı ve Hastalıkları, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Fiziksel Tıp ve Rehabilitasyon, Kardiyoloji, Mikrobiyoloji, Nefroloji, Nöroloji, Patoloji. Cerrahi Klinikler: Anestezi, Beyin Cerrahi, Çocuk Cerrahi, Göz Hastalıkları, Genel Cerrahi, Göğüs Cerrahi, Kadın Doğum Hastalıkları, Kalp Damar Cerrahi, Kulak Burun Boğaz Cerrahi, Ortopedi, Plastik, Rekonstrüktif ve Estetik Cerrahi, Üroloji. Diğer Hizmetler: Yoğun Bakım.