Tomografi ile birçok iç organ görüntülenebilir, bunlar arasında: Beyin: Beyin tümörleri, inme, kanama ve anevrizma gibi durumlar. Akciğerler: Pnömoni, akciğer kanseri, pulmoner emboli. Kalp: Koroner arter hastalığı, kalp krizi, kalp kapakçığı hastalıkları. Karın: Karaciğer hastalıkları, böbrek hastalıkları, pankreas hastalıkları, bağırsak hastalıkları. Kemikler: Kırıklar, osteoporoz, kemik tümörleri. Diğer organlar: Sinüsler, kulaklar, gözler, boyun, omurga. Ayrıca, tomografi ile damar yapıları ve yumuşak dokular da incelenebilir.