Kawasaki hastalığının belirtileri genellikle üç aşamada ortaya çıkar: 1. Birinci aşama (yüksek ateşle başlayan aşama): 39°C'nin üzerinde, 5 günden fazla süren ve ateş düşürücülere yanıt vermeyen ateş; yoğun akıntı olmadan aşırı derece kırmızı gözler; vücutta ve genital bölgede kızarıklık; kırmızı, kuru, çatlamış dudaklar ve çileğe benzer şişmiş kırmızı bir dil; avuç içlerinde ve ayak tabanlarında şişkin, kırmızı deri tabakası; özellikle boyunda bölgesinde şişmiş lenf düğümleri; huzursuzluk. 2. İkinci aşama (ateş sonrası belirtiler): ellerde ve ayaklarda, özellikle parmak uçlarında, genellikle büyük parçalar halinde soyulma; eklem ağrısı; ishal; kusma; karın ağrısı. 3. Üçüncü aşama (belirtilerin kaybolması): komplikasyon gelişmedikçe belirtiler yavaş yavaş kaybolma eğilimindedir; tüm klinik bulguların kaybolduğu ve sedimentasyon değerinin düştüğü nekahat dönemi 6. haftadan sonra başlar. Kawasaki hastalığı belirtilerinin çoğu ya da tamamı, 1 yaşından küçük ve 5 yaşından büyük çocuklarda görülmeyebilir. Kawasaki hastalığı şüphesi durumunda bir sağlık kuruluşuna başvurulması önerilir.