PCR

HES (Hayat Eve Sığar) kodu ve PCR testi farklı kavramlardır. HES kodu, COVID-19 salgını sırasında ulaşım araçları ve kamu binalarına girişi düzenlemek ve pozitif vakalarla temas eden kişilerin izlenmesini sağlamak amacıyla kullanılan bir uygulamadır. PCR testi ise, bir patojenin (örneğin virüs veya bakteri) genetik materyalinin bir örnekte bulunup bulunmadığını tespit etmek için kullanılan moleküler bir tanı aracıdır.

PCR testi anında sonuç vermez, ancak iki farklı türde uygulanabilir: 1. Gerçek zamanlı PCR: Bu yöntemde test sonucu 1-3 saat içinde çıkar. 2. Hızlı sonuç veren PCR: Bu testin sonucu 15 dakikadan 1,5 saate kadar kısa bir sürede elde edilebilir.

PCR ve antijen testleri, farklı prensiplere dayanan ve farklı amaçlar için kullanılan tıbbi testlerdir. PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) testi, bir patojenin genetik materyalini tespit eden moleküler bir tanı aracıdır. Antijen testleri ise, vücutta bulunan belirli virüs proteinlerini tespit etmeye yönelik testlerdir. Özetle, PCR testleri daha hassas ve kesin sonuçlar sunarken, antijen testleri daha hızlı sonuç verir.

PCR testi pozitif çıktığında yapılması gerekenler şunlardır: 1. Karantina: Hasta kişi kendini karantinaya almalı ve evden çıkmamalıdır. 2. Doktora Başvuru: Test sonucunu öğrendikten sonra bir doktora başvurulmalıdır. 3. Tedavi: Doktorun talimatlarına uygun şekilde ilaçlar kullanılmalıdır. 4. Temaslıların Bildirilmesi: Pozitif çıkan kişinin, son 14 gün içinde temas ettiği kişilere haber vermesi ve onların da karantinaya alınması sağlanmalıdır. PCR testinin pozitif çıkması, kişinin koronavirüse yakalandığını ve virüsü taşıdığını neredeyse kesin olarak gösterir.

PCR testi ile çeşitli hastalıkların teşhisi konulabilir, bunlar arasında: Viral hastalıklar: COVID-19, grip, HIV, hepatit, varicella zoster virüsü, Epstein-Bar virüsü gibi. Bakteriyel hastalıklar: Tüberküloz, boğmaca, streptococcus bakterisine bağlı boğaz enfeksiyonları, e.coli ve clostridium difficile gibi bağırsak enfeksiyonları. Genetik bozukluklar: Kalıtsal hastalıkların teşhisi ve taşıyıcı taramaları. Kanser: Mesane kanseri, meme kanseri, kolorektal kanser ve endometrial kanser gibi bazı kanser türlerinin tanısında kullanılır. Adli tıp: DNA profilleme ve babalık testleri. PCR testi, ayrıca gıda güvenliği ve tarım gibi sektörlerde de hastalık etkenlerinin tespitinde kullanılır.

Domuz gribi (H1N1) teşhisi için PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) testi yapılır.

PCR ve antijen testleri farklı test türleridir, ancak her ikisi de enfeksiyonların teşhisinde kullanılır. PCR testi, polimeraz zincir reaksiyonu anlamına gelir ve bir patojenin genetik materyalini tespit eden moleküler bir tanı testidir. Antijen testi ise, belirli bir viral antijenin varlığını tespit eden hızlı teşhis testleridir.

BSA (bovine serum albumin) değeri, PCR (polimeraz zincir reaksiyonu) işlemlerinde genellikle 0.01 µg/µl ile 0.5 µg/µl arasında kullanılır.

PCR testi sonucu genellikle 1 ila 3 gün arasında çıkar. Ancak, testin yapıldığı hastaneye göre bu süre değişebilir.

PCR testi ile çeşitli viral ve bakteriyel hastalıkların teşhisi yapılabilir. Bunlardan bazıları şunlardır: COVID-19: SARS-CoV-2 virüsünün tespiti. Grip (Influenza): İnfluenza virüsünün genetik materyalinin tespiti. HIV: İnsan Bağışıklık Yetmezliği Virüsü enfeksiyonunun teşhisi. Hepatit (B ve C tipleri): Hepatit virüslerinin genetik materyalinin tespiti. Tüberküloz (Verem): Mycobacterium tuberculosis bakterisinin tespiti. Boğmaca (Pertussis): Bordetella pertussis bakterisinin varlığının belirlenmesi. Lyme Hastalığı: Borrelia burgdorferi bakterisinin genetik materyalinin tespiti. Ayrıca, genetik bozukluklar ve kanser tanısında da PCR testi kullanılır.

PCR'da "flora" terimi, genellikle mikroflora analizi bağlamında kullanılır ve bu analiz, bir örnekte bulunan bakterilerin varlığını ve türünü belirlemeyi amaçlar. Bu analiz, cinsel yolla bulaşan hastalıkların ve diğer iltihaplı süreçlerin teşhisinde yardımcı olur.

Türkiye'nin yerli PCR testleri arasında iki önemli seçenek bulunmaktadır: 1. Yakın Doğu Üniversitesi'nin PCR Tanı ve Varyant Analiz Kiti: Bu kit, Yakın Doğu Üniversitesi bilim insanları tarafından geliştirilip, Hibrigen Biyoteknoloji ile birlikte üretilerek Türkiye'de de kullanılmaya başlanmıştır. 2. Bioeksen'in PCR Test Kiti: KOSGEB desteği ile kurulan Bioeksen şirketi, FDA ve DSÖ onayı alan PCR test kitleri üretmektedir ve bu kitler Türkiye'de yaygın olarak kullanılmaktadır.

Mikrosatelit analizi şu adımlarla gerçekleştirilir: 1. Numune Toplama: DNA analizi için kan, tükürük, saç veya doku örnekleri kullanılır. 2. DNA İzolasyonu: Numuneden DNA izole edilir, bu işlem hücrelerin yapısını parçalayarak ve DNA'yı saflaştırarak yapılır. 3. PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu): DNA'nın belirli bölgeleri çoğaltılır, bu, inceleme yapılacak DNA dizilerinin miktarını artırır. 4. Jel Elektroforezi: Çoğaltılan DNA parçaları, jel elektroforezi kullanılarak boyutlarına göre ayrılır. 5. Görselleştirme ve Analiz: Ayrılan DNA parçaları, genellikle boyama yöntemleriyle görselleştirilir ve mikrosatelit analizi yapılır. Ek olarak, mikrosatelit analizi için 5' floresan işaretli primerler kullanılarak PCR işlemi yapılır ve ABI 310 Genetik Analiz Cihazı gibi özel cihazlar kullanılır.

PCR testi ve hızlı test aynı şeyler değildir. PCR testi, polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) olarak bilinir ve virüslerin genetik materyalini tespit etmek için son derece hassas ve spesifik bir yöntemdir. Hızlı testler ise daha kısa sürede, genellikle 15 ila 30 dakika içinde sonuç verecek şekilde tasarlanmıştır.

PZR kısaltmasının açılımı "Polimeraz Zincir Reaksiyonu" (İng. polymerase chain reaction, PCR) olarak bilinmektedir.

Omicron varyantının tespiti için PCR testi yapılır. Testin detayları şu şekildedir: 1. Örnek Alımı: Burun ve boğazdan veya öksürdükten sonra çıkan balgamdan örnek alınır. 2. Gen Dizilimi: Örnek, gen dizilimi adı verilen teknikle incelenir. 3. Hızlı Antijen Testleri: Omicron'un tespitinde hızlı antijen testleri de kullanılabilir, ancak bu testler sadece varyantın varlığını veya yokluğunu gösterir, türünü belirtmez. Test sonuçları, genellikle 1-3 saat içinde çıkar, ancak yoğunluğa göre 24 saati bulabilir.

PCR (Polymerase Chain Reaction) ve Real-Time PCR (qPCR) arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Tespit Yöntemi: PCR'de amplifiye edilen DNA'nın tespiti, süreç tamamlandıktan sonra yapılır ve bu genellikle jel elektroforezi ile yapılır. 2. Kuantifikasyon: PCR nitel bir teknik olup, hedef DNA'nın mevcut olup olmadığını belirler, ancak kesin miktar ölçümü yapmaz. 3. Zaman Verimliliği: PCR, ek adımlar ve jel elektroforezi gibi işlemler gerektirdiği için daha fazla zaman alır. 4. Hassasiyet ve Doğruluk: Real-Time PCR, daha yüksek hassasiyet ve özgüllük sunar, çünkü küçük DNA miktarlarını bile tespit edebilir ve yakından ilişkili dizileri ayırt edebilir. 5. Uygulama Alanları: PCR, klonlama, dizileme, mutagenez çalışmaları ve patojen tespiti gibi görevler için uygundur.

Boş PCR kiti, PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) testi için gerekli olan ancak örnek içermeyen kit anlamına gelebilir. Bu kitler, nükleik asit ekstraksiyonu ve saflaştırma adımları olmadan doğrudan kan, doku veya diğer örnekleri amplifikasyon için kullanmak üzere tasarlanmıştır.

PCR testi sonucu pozitif çıktığında, kişinin koronavirüs ile enfekte olduğu ve virüsü taşıdığı anlaşılır. Bu durumda kişi: 1. Kendisini karantinaya almalıdır ve doktoruyla iletişime geçmelidir. 2. Asla acil durumlar dışında evden çıkmamalı, hastaneye gitmesi gerektiğinde ise ambulansı arayarak izole bir şekilde ulaşım sağlamalıdır. 3. Evdeki diğer kişilerle temas etmemeli, yemek yerken kullandığı eşyaları kendisi yıkamalı ve diğer kişilerden uzak tutmalıdır. 4. Tedavi süresi boyunca karantina kurallarına tam bağlılık göstermeli ve doktorunun talimatlarına uygun şekilde ilaçlarını kullanmalıdır. Ayrıca, pozitif çıkan kişilerin yakın temas kurdukları kişiler de dikkatli olmalı ve kendilerini karantinaya almalıdır.

Antijen testleri, bazı durumlarda PCR testlerine göre daha güvenilir kabul edilir, çünkü: 1. Hızlı sonuç verme: Antijen testleri genellikle 10-30 dakika içinde sonuç verir, bu da acil durumlarda ve büyük ölçekli taramalarda avantaj sağlar. 2. Kolay uygulanabilirlik: Tükürük veya burun sürüntüsü gibi invaziv olmayan örneklerle çalışır, bu da hem sağlık profesyonelleri hem de hastalar için daha rahat bir deneyim sunar. 3. Maliyet etkinliği: Antijen testleri, genellikle daha uygun maliyetlidir. Ancak, antijen testlerinin doğruluğu PCR testlerine kıyasla daha düşüktür ve negatif sonuçlar her zaman enfeksiyonun olmadığını garanti etmez; doğrulama için daha hassas testler gerekebilir.