Otopside kullanılan bazı ameliyat aletleri şunlardır: 1. Bıçaklar: Deri-kıkırdak bıçağı, diseksiyon bıçakları, bistüri, beyin bıçağı. 2. Makaslar: Kostotom, bağırsak makası, diseksiyon makasları. 3. Keski ve Raspatorium: Kafatasını açmak için kullanılır. 4. Pensetler: Doku ve organları tutmak için kullanılır. 5. Testereler: Düz testere, iki yüzlü testere, elektrikli testere. 6. Kepçe: Vücut boşluklarında sıvıları ölçmek ve boşaltmak için kullanılır. 7. Baş ve Sırt Destekleri: Otopsi sırasında cesedin pozisyonunu ayarlamak için kullanılır. Ayrıca, fotoğraf makinası ve biyomikroskop da otopsi sürecinde faydalı olabilir.