Mideden parça alınmasına mide biyopsisi denir. Mide biyopsisi, endoskopi yöntemi ile mideden parça alınarak mikroskop altında incelenmesi ve tanı konulması işlemidir. Mide biyopsisinin amacı doku örneği alınan dokuda bakteri ya da kanserli hücre olup olmadığını anlayabilmek için doktor tarafından istenmektedir. Mide biyopsisi istenen kişiler için şu durumlara bakılır: Sebebi belirlenemeyen ve sürekli mide ağrısı çeken hastalar; 5 yıl ve üstü reflü hastaları; 50 yaş üstü bireyler; Sindirim sistemi kanlanması olan hastalar; Yutma güçlüğü yaşayan hastalar; Yutarken ağrı duyan hastalar; Aşırı kilo kaybı yaşayan hastalar; Dışkıda gizli kan testi pozitif gelen hastalar. Mide biyopsisi işlemlerinin yapılma nedenleri arasında ayrıca mide ülseri, gastrit gibi hastalıklara neden olan bakterilerin varlığını tespit etmek, mide iç duvarlarındaki mukoza iltihaplarını tespit etmek, mide kanseri erken teşhisi, mide iç duvarlarında oluşan anormal büyümelerin tespiti, çölyak hastalığı teşhisi ve diğer mide hastalıklarının teşhisi de yer alır.