2025 yılı TMC Kongresi'nde ele alınacak konular hakkında bilgi bulunamadı. Ancak, 2024 yılında düzenlenen XLI. Türk Mikrobiyoloji Kongresi'nde aşağıdaki konuların ele alındığı bilinmektedir: Olgu tartışmaları ve uzmanı ile çözümleme. Açık ve eğitim oturumları. Bakteriyofaj, antibiyotik direnci, parazitoloji, biyoinformatik, immünoloji, tüberküloz, yapay zeka ve kariyer fırsatları gibi konularda kurslar. 5 Dakikada Tezini Anlat etkinliği. Kongre konuları, çalışma gruplarının ve katılımcıların önerileri doğrultusunda şekillenmektedir.