Biyokimya

Transkripsiyondaki üç aşama şunlardır: 1. Başlama (İnitasyon): DNA'nın çift sarmalının, mRNA sentezi yapılacak bölgede kısmen gevşetilmesiyle başlar. 2. Uzama (Elongasyon): RNA polimeraz enzimi, DNA replikasyonuna benzer şekilde baz eşleşmesi yaparak nükleotitleri ekler ve kalıp DNA boyunca ilerler. 3. Sonlanma (Terminasyon): Transkripsiyonun tamamlanması için, RNA polimerazın kalıp DNA'dan ayrılması ve yeni sentezlenmiş olan mRNA'yı serbest bırakması gerekir.

Hidrolize uğrayan maddeler şunlardır: 1. Organik bileşikler: Yağlar, karbohidratlar (nişasta, glikojen), proteinler. 2. İnorganik bileşikler: Metal tuzları, ametal halojenürler. 3. Diğer maddeler: Çay şekeri (sakkaroz), odun artıklarındaki selüloz. Bu maddeler, su (veya başka bir sıvı) ile reaksiyona girerek daha küçük birimlere ayrılırlar.

Glikozu oluşturan monomer glikozun kendisidir.

SNP iki farklı anlamda kullanılabilir: 1. Biyokimya Terimi: Single-Nucleotide Polymorphism (Tek Nükleotid Polimorfizmi) anlamına gelir ve bir popülasyona göre polimorfik olan tek bir DNA baz çiftini ifade eder. 2. Politika Terimi: Scottish National Party (İskoç Millî Partisi) kısaltmasıdır. Ayrıca, kimya alanında Sodium NitroPrusside için de kullanılır.

BOD tıpta "biyokimyasal oksijen ihtiyacı" (Biochemical Oxygen Demand, BOD) anlamına gelir. Bu terim, suda biyolojik olarak parçalanabilen organik maddenin miktarını ifade eder ve atık suların kirlilik derecesini belirlemede kullanılır.

Fosfolipitler enerji vermezler, daha çok yapısal işlevlere sahiptirler.

ATP (Adenozin trifosfat), enerji kaynağı olarak kabul edilir çünkü ikinci ve üçüncü fosfat grupları arasındaki bağda kolayca salınabilir enerji barındırır. ATP'nin enerji kaynağı olarak kabul edilmesinin diğer nedenleri şunlardır: Hücresel metabolizma. Çok yönlü kullanım. Enerji depolama ve taşıma. ATP, tüm canlı organizmaların temel enerji tüketen süreçleri için kullanılır.

Q harfi farklı alanlarda farklı anlamlar taşır: 1. Matematik ve Geometri: Q, rasyonel sayılar için kullanılan bir harftir ve İngilizcede "Quotient" kelimesinin baş harfinden gelir. 2. Biyokimya ve Takviyeler: Koenzim Q10 (CoQ10) olarak bilinen, enerji üretiminde önemli rol oynayan bir antioksidanın sembolüdür. 3. Fizik: Q, kütle kuvvetinin sembolüdür ve Newton birim cinsinden ölçülen kuvvetin kütle ile oluşturduğu etkiyi ifade eder.

mRNA (mesajcı RNA) ve DNA (deoksiribonükleik asit) aynı şeyler değildir. DNA, çoğu canlı organizmada temel kalıtsal materyaldir ve genetik bilgiyi depolamak ile protein sentezini düzenlemek gibi işlevlere sahiptir. mRNA ise DNA'dan transkripsiyon yoluyla üretilen, tek sarmallı ve riboz şekeri içeren bir RNA türüdür.

GTP (Guanosine Triphosphate) ve ATP (Adenosine Triphosphate) arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Yapısal Farklılık: GTP, guanin bazına sahipken, ATP adenine sahiptir. 2. Enerji Rolü: ATP, hücrenin birincil enerji para birimidir ve çeşitli biyokimyasal reaksiyonlarda kullanılır. 3. Dönüşüm ve Düzenleme: ATP, enerji salınımı sırasında ADP (Adenosine Diphosphate) ve AMP (Adenosine Monophosphate) 'ye dönüşürken, GTP GDP (Guanosine Diphosphate)'ye dönüşür ve genellikle G-proteinlerinin aktivasyonunda yer alır. 4. Enzim Kullanımı: ATP ve GTP'yi kullanan enzimler genellikle farklıdır.

Oksidasyon ve oksidatif stres kavramları şu şekilde açıklanabilir: 1. Oksidasyon: Normal metabolik faaliyetler sırasında hücrelerde enerji üretimi için oksijen kullanılır ve bu süreç sırasında reaktif oksijen türleri (ROS) oluşur. Bu durum, oksidasyon olarak adlandırılır. 2. Oksidatif Stres: Hücrelerdeki oksidasyon süreçlerinin dengesizliği ve serbest radikallerin aşırı birikimi sonucu oluşan bir durumdur. Oksidatif stresin etkileri arasında DNA hasarı, proteinlerin ve lipitlerin oksidasyonu, hücresel fonksiyonların bozulması ve çeşitli hastalıkların gelişimi yer alır.

Biyokimyacı, canlı organizmaların moleküler ve kimyasal yapılarını inceleyen bilim insanıdır. Görevleri arasında şunlar yer alır: Deney Tasarımı ve Yürütme: Biyokimyasal süreçler hakkında daha fazla bilgi edinmek için deneyler tasarlar ve yürütür. Veri Analizi ve Yorumlama: Deney sonuçlarını analiz eder ve yorumlar, istatistiksel yöntemler kullanır. İlaç ve Gıda Geliştirme: Yeni ilaçlar, takviyeler ve gıda ürünleri geliştirir veya mevcut ürünlerin besin içeriğini iyileştirir. Araştırma Yapma: Laboratuvar ortamında canlı organizmalarla çalışarak genetik mühendislik ve hücre kültürü gibi alanlarda araştırmalar yapar. Modern Yazılım Kullanımı: Biyokimyasal analizler için gerekli yazılım ve teknolojileri etkin bir şekilde kullanır. Biyokimyacılar, hastaneler, üniversiteler, araştırma enstitüleri, ilaç ve biyoteknoloji şirketleri gibi çeşitli kurumlarda çalışabilirler.

PDB (Protein Data Bank) dosyalarında bulunan veriler şunlardır: 1. Atomik Koordinatlar: Moleküldeki her atomun X, Y ve Z koordinatları. 2. Amino Asit Dizisi: Proteindeki amino asitlerin dizilimi, her amino asit üç harfli bir kodla temsil edilir. 3. Bağlantı Bilgileri: Atomların nasıl bağlandığını gösteren detaylar, bağ türleri ve mesafeler. 4. İkincil Yapı Bilgileri: Proteinin yapısal elemanları (alfa heliksler, beta tabakalar) hakkında bilgiler. 5. Meta Veriler: Yapının belirlenme yöntemi (X-ışını kristalografisi, NMR), çözünürlük ve ilgili bilimsel literatüre referanslar. Ayrıca, PDB dosyaları ligandlar ve çözücü moleküller gibi ek bilgileri de içerebilir.

GTP (Guanozin Trifosfat) ve GTP (GPRS Tünel Protokolü) farklı alanlarda işlev görür: 1. GTP (Guanozin Trifosfat): - Enerji Aktarımı: Hücre içindeki enerji aktarımında rol oynar ve ATP'nin üretilmesine eşdeğerdir. - Genetik Translasyon: Polipeptid sentezinde enerji kaynağı olarak kullanılır. - Mikrotübül Dinamikleri: Mikrotübül polimerleşmesinde GTP hidrolizi, mikrotübülün stabilitesini düzenler. - Mitokondriyal İşlev: Proteinlerin mitokondriyal matrikse translokasyonunda hem ATP hem de GTP gereklidir. 2. GTP (GPRS Tünel Protokolü): - Mobil Ağlar: Mobil cihazlarda veri iletimini sağlamak için kullanılır, 2G ve 3G ağlarında, ayrıca 4G ve 5G ağlarında da genişletilmiştir. - Tünel Kurulumu ve Bakımı: Mobil cihazlar ile çekirdek ağ arasında tünellerin kurulması, sürdürülmesi ve sonlandırılmasını yönetir.

Glikoliz sürecinde çeşitli enzimler görev alır. İşte bazıları: 1. Heksokinaz: Glikozun fosforilasyonunu katalizler ve glikoz-6-fosfat üretir. 2. Fosfofruktokinaz (PFK-1): Fruktoz-6-fosfatın fosforilasyonunu sağlar ve fruktoz-1,6-bifosfat oluşturur. 3. Aldolaz: Fruktoz-1,6-bifosfatı dihidroksiaseton-fosfat ve gliseraldehit-3-fosfata ayırır. 4. Trioz Fosfat İzomeraz: Dihidroksiaseton-fosfatı gliseraldehit-3-fosfata dönüştürür. 5. Gliseraldehit-3-Fosfat Dehidrojenaz: Gliseraldehit-3-fosfatı oksitleyerek 1,3-bisfosfogliserat oluşturur. 6. Fosfogliserat Kinaz: 1,3-bisfosfogliserattan ATP üretir. 7. Piruvat Kinaz: Fosfoenolpiruvattan (PEP) son ATP molekülünü oluşturur.

Laktoz, süt şekeri olarak da bilinen bir disakkarit türüdür.

Özümlemenin diğer isimleri şunlardır: Asimilasyon; Anabolizma; Yadımlama karşıtı.

Şişli Etfal Hastanesi'nin biyokimya laboratuvarı, Seyrantepe Yerleşkesi'nde bulunmaktadır.

Tıpta "VAPA" kısaltması birkaç farklı anlama gelebilir: 1. Virulence-Associated Protein A (VapA). 2. Veterinary Association for the Protection of Animals (Veteriner Hayvan Koruma Derneği). 3. Visceral Artery Pseudoaneurysms (İç Organ Arter Psödoanevrizmaları). 4. Virginia Academy of Physician Assistants (Virginia Doktor Asistanları Akademisi).

Ligand — tirozin kinaz reseptörlerinin fosfotirozin bölgelerine bağlanarak aktiflenen bir sinyal molekülüdür.