Isıl işlemin yan etkileri şunlardır: 1. Besin Değerlerinin Kaybı: Yüksek sıcaklık ve uzun süreli pişirme, özellikle suda çözünür vitaminlerin (C vitamini ve bazı B vitaminleri) kaybına neden olabilir. 2. Aroma ve Tat Değişiklikleri: Aşırı ısıl işlem, gıdaların aromasını ve tadını bozabilir; örneğin, şekerlerin karamelize olması gibi. 3. Renk Değişiklikleri: Isıl işlem sırasında renk maddeleri tahrip olabilir ve gıdalar istenmeyen renklere dönüşebilir. 4. Enzim Aktivitesinin Durması: Isıl işlem, gıdalardaki enzimlerin aktivitesini durdurarak bozulma sürecini engeller ancak bu, besin elementlerinin kaybına yol açabilir. 5. Malzeme Hasarı: Hızlı ısıtma veya soğutma, düzensiz gerilmelere neden olarak malzemelerin bozulmasına veya bükülmesine yol açabilir.