Rektörlük mülakatına, YÖK'e özgeçmişlerini bildiren ve gerekli görüldüğü takdirde mülakata alınan rektör adayları çağrılır. Bu süreçte genel olarak şu adımlar izlenir: 1. Rektör adayları, başvurularını YÖK Başkanlığına yaparlar. 2. YÖK, başvuruları inceler ve mülakat yaparak adaylar arasından 3'ünü belirler. 3. Belirlenen 3 aday, atanmak üzere Cumhurbaşkanına sunulur.