Hücre zarından madde geçişleri iki ana kategoriye ayrılır: pasif taşıma ve aktif taşıma. Pasif taşıma, enerji harcanmadan maddelerin yüksek konsantrasyonlu bir ortamdan düşük konsantrasyonlu bir ortama doğru hareket etmesini içerir. Üç temel mekanizması vardır: 1. Difüzyon: Moleküllerin rastgele hareketi sonucu yüksek konsantrasyonlu bölgeden düşük konsantrasyonlu bölgeye net hareketi. 2. Osmoz: Su moleküllerinin yarı geçirgen bir zar boyunca, su konsantrasyonunun yüksek olduğu ortamdan düşük olduğu ortama doğru hareketi. 3. Kolaylaştırılmış difüzyon: Bazı moleküllerin hücre zarından geçişini kolaylaştıran taşıyıcı proteinlerin yardımıyla gerçekleşen taşıma. Aktif taşıma ise maddelerin konsantrasyon gradyanına karşı, yani düşük konsantrasyonlu ortamdan yüksek konsantrasyonlu ortama doğru taşınmasını ifade eder ve enerji (ATP) gerektirir. İki temel mekanizması vardır: 1. Pompalar: Zara gömülü proteinler, ATP enerjisi kullanarak maddeleri konsantrasyon gradyanına karşı taşır. 2. Endositoz ve ekzositoz: Hücrenin büyük molekülleri veya partikülleri hücre zarı aracılığıyla alıp vermesini sağlayan mekanizmalar.