Uluğ Bey, 27 Ekim 1449'da, oğlu Abdüllatif Mirza'nın emriyle, Semerkant yakınlarında bir çatışmada öldürülmüştür. Uluğ Bey, hükümdarlık hak ve iddiasından vazgeçip oğlunun egemenliği altında yaşamaya razı olmuş ve Abdüllatif’ten hacca gitmek için izin istemiştir. Uluğ Bey'in ölümünün bir diğer sebebi de, halktan toplanan vergilerin kumandanlara ve çevresindekilere dağıtmayıp halkın yararına ve ilmî araştırmalara, medrese, kütüphane ve rasathaneye harcanması olarak gösterilmektedir.