Bronkoskopi çeşitli tıbbi nedenlerle yapılır ve iki ana amaçla kullanılır: 1. Tanısal amaçlı: Akciğer grafisi veya bilgisayarlı tomografide anormal bulguların varlığı, tedaviye cevap vermeyen kronik öksürük, öksürükle birlikte kan gelmesi ve 2 haftadan uzun süren ses kısıklığı gibi durumlarda uygulanır. 2. Tedavi amaçlı: Hava yollarındaki yabancı cisimleri çıkarmak, trakea ve ana bronşlardan kaynaklanan iyi ve kötü huylu tümörleri girişimsel yöntemlerle (lazer, argon plazma koter, kriyokoter, elektrokoter vb.) tedavi etmek, ayrıca trakea ve bronşların darlıklarını stent takarak açmak için kullanılır.