Nöroanatomik bozukluklar, beyin, omurilik ve periferik sinirlerin anatomik yapılarındaki bozukluklardır. Bazı örnekler şunlardır: Frontal lob lezyonları: Akut frontal lezyonlarda bilinç düzeyi, dikkat, duygu ve duygudurum değişiklikleri görülür. Serebellum bozuklukları: Gövde ataksisi, ipsilateral ekstremite ataksisi, dismetri, disdiadokokinezi, pandüler refleks, nistagmus ve dizartri gibi hareket ve denge bozuklukları. Limbik sistem bozuklukları: Limbik sistemdeki irritatif lezyonlar, varsanı, cinsel dürtüde değişiklik, korku, öfke ve saldırganlık gibi psikiyatrik belirtilerin olduğu psikomotor nöbetlere neden olabilir. Diensefalon bozuklukları: Talamus lezyonlarında bellek sorunları ortaya çıkar. Bu bozukluklar, nörolojik durumların doğru teşhisi ve tedavisi için nöroanatomi bilgisi gerektirir.