Ökaryotlar, dört ana hücre tipine ayrılır: hayvanlar, bitkiler, mantarlar ve protistalar. Hayvan hücreleri: Hücre duvarı ve kloroplastları yoktur, kofulları daha küçüktür. Bitki hücreleri: Hücre duvarı kitinden oluşmuştur ve gelişmiş mantar türlerinin hücreleri septum denen gözenekli bölmelerden oluşur. Mantar hücreleri: Basit mantarlarda bölmeler bulunmaz, yalnızca en ilkel mantarlarda kamçılı hücreler vardır. Protistalar: Tek hücreli veya kolonal ökaryotlardan oluşur. Bu nedenle, ökaryotlar genel olarak dört ana çeşit hücre içerir.