DNA

DNA'nın yarı korunumlu eşlemesinin nedeni, kalıtsal özelliklerin yeni hücrelere eşit şekilde aktarılmasını sağlamaktır. Bu süreçte, iki zincirli sarmal DNA'nın her bir ipliği kalıp görevi yaparak kendine yeni bir eş DNA ipliği oluşturur.

Evet, küçük uzaylının DNA'sı analiz edilmiştir. Şili'nin Atacama Çölü'nde bulunan ve uzaylı olduğu iddia edilen varlığın DNA analizi, ABD'li bilim insanı Garry Nolan tarafından gerçekleştirilmiştir.

Farklı hücrelerin DNA'ları, gen ifadesi ve kullanım şekli açısından farklıdır. Farklılıkların nedenleri arasında: - Epigenetik modifikasyonlar. - Hücrelerin bulunduğu ortam ve hücrelerin yaşına bağlı olarak değişen gen aktivasyon düzeyleri. - Hormonal ve çevresel sinyaller. Ayrıca, aynı tür içindeki canlıların nükleotid dizilişleri ve sayıları da farklıdır, bu da akrabalık ilişkilerini açıklar.

Cennet papağanının cinsiyeti, 3 aylıktan itibaren gaga rengi ve ayaklarındaki beneklerin yoğunluğuna bakılarak tahmin edilebilir.

50 yıl sonra ortaya çıkan gerçeklerden bazıları şunlardır: Doğum karışıklığı: İngiltere'de 1967 yılında aynı hastanede doğan iki kadın, 50 yıl sonra DNA testi sayesinde farklı ailelere verildiklerini öğrendi. Kimlik tespiti: ABD'nin Pensilvanya eyaletinde, 50 yıl önce donmuş halde bulunan bir erkeğin kimliği, parmak izleri ve diş röntgenleri sayesinde tespit edildi. Babalık yalanı: Muğla'da, 50 yıl boyunca babası sandığı kişinin aslında öz babasının katili olduğunu öğrenen bir kadın, DNA testi ile gerçeği ortaya çıkardı.

PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) aşamaları üç ana bölümden oluşur: 1. Denatürasyon (Bozulma) Aşaması. 2. Bağlanma Aşaması. 3. Uzama Aşaması.

DNA insert vektörü, yabancı bir DNA parçasının yerleştirilmesi için kullanılan küçük bir DNA parçasıdır. Bu vektörler, klonlama amacıyla kullanılır ve şu özelliklere sahiptir: - Kendi kendini çoğaltma: Host hücre içinde çoğalabilme yeteneği. - Restriction sitesi: Hedef DNA'nın yerleştirilebileceği bölge. - Seçilebilir marker: Antibiyotik direnci gibi özelliklerle rekombinant organizmanın taranmasını sağlayan gen. - Boyut: Host hücreye kolayca entegre olabilecek kadar küçük. Yaygın vektör türleri arasında plazmidler, bacteriofajlar ve yapay kromozomlar bulunur.

DNA'da hidrojen bağı ve fosfodiester bağını yapan moleküller şunlardır: 1. Hidrojen Bağları: DNA'daki baz çiftleri arasında hidrojen bağlarını nükleotidler oluşturur. 2. Fosfodiester Bağları: DNA'nın şeker-fosfat omurgasını nükleotidlerin fosfat grupları ile deoksiriboz şekerleri arasındaki fosfodiester bağları oluşturur.

DNA veri bankasında şunlar bulunur: 1. Suç şüphelileri ve hükümlüler. 2. Olay yerinden alınan örnekler. 3. Kayıp kişiler. DNA veri bankasına veri girişi şu kurumlar tarafından yapılır: Adli Tıp Kurumu, Jandarma Genel Komutanlığı Kriminal Dairesi Başkanlığı ve Emniyet Genel Müdürlüğü Kriminal Dairesi Başkanlığı.

Yeni Nesil Sekanslama (NGS), milyonlarca DNA parçasının aynı anda dizilenmesine olanak tanıyan modern bir sekanslama yöntemidir. NGS'nin temel adımları: 1. DNA Hazırlığı: DNA örneği toplanır ve saflaştırılır. 2. DNA Parçalanması: DNA, daha küçük parçalara ayrılır. 3. Kütüphane Hazırlığı: DNA parçalarına adaptörler eklenir ve sekanslama için hazır hale getirilir. 4. Dizileme: DNA dizileri, sekanslama makinesinde okunur. 5. Veri Analizi: Elde edilen dizilim verileri, biyoinformatik araçlarla analiz edilir. NGS'nin kullanım alanları: genomik araştırmalar, tıbbi genetik, tarım, adli tıp gibi birçok alanda genetik bilgiyi açığa çıkarmak ve biyolojik süreçleri anlamak için kullanılır.

Homolog rekombinasyon ve homolog olmayan uç birleştirme çift zincir kırıklarının tamir mekanizmasında görev alır.

Evet, guanin bazı hem DNA hem de RNA moleküllerinde aynıdır.

Bst polimeraz, Geobacillus stearothermophilus bakterisinden türetilen, DNA polimeraz I'in büyük bir parçası olan bir enzimdir. Özellikleri: - Termostabilite: Orta düzeyde termostabiliteye sahiptir, bu da onu isotermal DNA amplifikasyon yöntemleri için uygun kılar. - Süreçlilik: Uzun DNA parçalarının verimli bir şekilde çoğaltılmasını sağlayan yüksek süreçliliğe sahiptir. - Fidelite: Hata oranını azaltmak için geliştirilmiş, daha güvenilir bir DNA çoğaltma doğruluğuna sahiptir. Kullanım alanları: Bst polimeraz, Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP), Whole Genome Amplification (WGA) ve Rolling Circle Amplification (RCA) gibi isotermal amplifikasyon tekniklerinde kullanılır.

Transdüksiyon ve transformasyon arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Transdüksiyon: Genetik bilginin virüs (bakteriyofaj) aracılığı ile bir bakteriden diğerine aktarılmasıdır. 2. Transformasyon: Bakterilerin, ortamlarında bulunan DNA parçalarını uygun enzimler ve özel zar kanalları yardımıyla hücre içine almasıdır.

Satellit bölge, DNA'da çok sayıda tekrar eden kısa nükleotit dizilerinden oluşan bir bölgedir. Bu bölgeler, kromozomun sentromer ve telomer gibi önemli yapılarıyla ilişkilidir ve sezyum klorid dansite gradient santrifüjü ile diğer DNA dizilerinden ayrılırlar.

Prokaryotik ve ökaryotik hücrelerde DNA replikasyonunun başlama noktası, replikasyon orijini olarak adlandırılan belirli DNA bölgelerinde belirlenir. Prokaryotik hücrelerde: - Tek bir dairesel DNA molekülü bulunur. - Replikasyon, bu DNA molekülünün tek bir başlangıç noktasından başlar. Ökaryotik hücrelerde: - Çoklu, doğrusal kromozomlarda düzenlenmiş daha fazla DNA bulunur. - Replikasyon, birden fazla replikasyon orijininde aynı anda başlayabilir ve her orijinde farklı proteinler gerektirir.

DNA'nın kendini eşlemesi sırasında bazı hatalar onarılabilir: 1. Yanlış eşleşme: Bir nükleotidin karşısına yanlış nükleotid yerleşmesi gibi hatalar, DNA onarım merkezi tarafından düzeltilebilir. 2. Eksik nükleotid: DNA zincirinde nükleotid eksikliği durumunda, karşı zincirdeki nükleotid bilindiğinden hata onarılabilir. Ancak, DNA ipliğinin her iki tarafında nükleotid olmaması gibi hatalar onarılamaz.

Forensic genetik, genetik analizin yasal ve cezai soruşturmalarda kullanılmasıdır. Bu alanın temel uygulamaları şunlardır: - Şüpheli tespiti: DNA profili oluşturarak, suç mahallindeki biyolojik kanıtları şüphelilerle veya veri tabanı profilleriyle eşleştirmek. - Soğuk vaka çözümü: Eski kanıtların modern DNA teknikleri kullanılarak yeniden incelenmesi ve çözülememiş davaların aydınlatılması. - Aklanma: Yanlışlıkla suçlanan kişilerin DNA analiziyle temize çıkarılması. - Afet mağduru tespiti: DNA profillerinin, doğal afetler veya toplu kazalarda kimliği belirsiz kalan kişileri tanımlamak için kullanılması. - Paternity ve kinship testi: Genetik testlerle biyolojik ilişkilerin belirlenmesi. Forensic genetik, etik ve yasal birçok zorluğu da beraberinde getirir, örneğin gizlilik, veri güvenliği ve genetik bilginin kötüye kullanılması gibi konular.

Sanger ve NGS (Next-Generation Sequencing) arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Sıralama Hacmi: Sanger dizilimi tek bir DNA parçasını sırayla dizerken, NGS milyonlarca DNA parçasını aynı anda dizebilir. 2. Sıralama Uzunluğu: NGS yöntemleri genellikle 100-200 baz uzunluğunda fragmanları okurken, Sanger dizilimi 700-1000 baza kadar uzun dizileri okuyabilir. 3. Maliyet: NGS, büyük miktarda DNA dizilimi yapıldığında daha maliyet etkilidir. 4. Keşif Gücü: NGS, nadir veya düşük frekanslı genetik varyantları daha iyi tespit edebilir ve daha geniş genetik çeşitlilik analizi yapabilir. Kullanım Alanları: - Sanger dizilimi, sınırlı sayıda kısa genetik bölgenin analizi için hızlı, güvenilir ve ekonomik bir yöntemdir. - NGS, tüm genomlar veya ekzomlar gibi geniş genetik bölgelerin araştırılması için tercih edilir.

Armonika Dijital, 2019 yılında İstanbul'da kurulmuş bir BT hizmetleri ve danışmanlığı şirketidir. Armonica adlı başka bir şirket ise, 2018 yılında İtalya'nın Padua şehrinde kurulmuş bir yazılım şirketidir ve Centric Software'e aittir. Bu nedenle, "Armonica dijital" ifadesinin kime ait olduğu, bağlama göre değişiklik gösterebilir.