Atomun bazı bilinmeyen özellikleri: Atomaltı parçacıklar: Atom, kuarklar ve leptonlar gibi daha küçük parçacıklardan oluşan atomaltı parçacıklar içerir. Nükleer reaksiyonlar: Atomun çekirdeği, nükleer fisyon (parçalanma) ve nükleer füzyon (birleşme) gibi reaksiyonlara girebilir. Dengenin olağan dışı hesaplamaları: Atom, içindeki dengenin olağan dışı hesaplamalarla var olduğu esrarengiz bir yapıdır. İyonlaşma: Atomların çarpışması veya kimyasal reaksiyona girmesi, elektron kazanmalarına veya kaybetmelerine neden olabilir. İzotoplar: Bir elementin farklı sayıda nötron içeren atomları izotop olarak adlandırılır ve bu izotoplar, elementin doğal halinden farklı olarak radyoaktiflik gibi özellikler gösterebilir.