Megane 3 Faz 1 ve Faz 2 arasındaki bazı farklar: Ön panjur: Faz 2'lerde rüzgarlıkların açısı daha eğik, Faz 1'lerde ise düzdür. Arka stoplar: Faz 1'lerde sinyal ışıklarının olduğu bölüm yuvarlak, Faz 2'lerde düzdür. Rpm göstergesi: Faz 1'lerde sağda, Faz 2'lerde soldadır. Yol bilgisayarı ekranı: Faz 2'lerde beyaz ışıklı, Faz 1'lerde turuncu ışıklıdur. Teyp: Faz 1'lerde kaset çalar, Faz 2'lerde CD veya MP3 çalar bulunur. Motor: 1.6 motor Faz 1'de 115 beygir, Faz 2'de 110 beygirdir. Jantlar: Faz 1'lerde 6 kollu, Faz 2'lerde 9 kollu çelik jantlar kullanılır. Kapı kolları: Faz 1'lerde krom benzeri bir renkte, Faz 2'lerde düz gri renktedir. Koltuk döşemeleri: Faz 1 ve Faz 2'de farklıdır. Emisyon normları: Bazı 1.5 dCi motorlar Faz 2'de Euro 5 emisyon normlarına yakındır.