Kateter ekimi mikrobiyolojisi, kateter infeksiyonlarının mikrobiyolojik olarak incelenmesi ve tanı yöntemlerini ifade eder. Kateter infeksiyonlarında sıkça görülen mikroorganizmalar: Gram pozitif bakteriler: Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus aureus, enterokoklar. Gram negatif bakteriler: E. coli, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella. Mantarlar: Candida türleri. Mikrobiyolojik tanı yöntemleri: Semikantitatif kültür: Kateterin 5 cm'lik uç kısmı kanlı agara ekilir, >15 CFU üreme olması pozitif sonuç olarak değerlendirilir. Kantitatif kültür: Kateterin intradermal ve intravasküler kısmı ekilir, 1000 koloni/ml üreme pozitif olarak kabul edilir. Kateter segmentlerinin direkt gram veya akridin oranj ile boyanması: 20 immersiyon alanında bir mikroorganizma görüldüğünde pozitif kabul edilir.