Kerkini'de iklim, sıcak ve ılıman olarak tanımlanır. Bazı özellikler: Yıllık ortalama sıcaklık: 14,2 °C. Yağış: Yıllık ortalama 680 mm, en fazla yağış Aralık ayında, en az yağış ise Ağustos ayında görülür. Yazlar: Haziran, Temmuz, Ağustos aylarında başlar ve bu aylarda sıcaklık 25,6 °C'ye kadar çıkar. Kışlar: Ocak ayında ortalama sıcaklık 2,9 °C'dir. Kerkini, Karadeniz ikliminin etkisi altındadır; bu iklim tipi yüksek nem ve bol yağış ile karakterizedir.