Beta ve alfa talasemi arasındaki temel fark, hangi globin zincirinin sentezinin etkilendiğidir. - Alfa talasemide, alfa globin zincirlerinin sayısında azalma olur. - Beta talasemide ise beta globin zincirlerinin miktarı azalır. Diğer farklılıklar: - Genlerin silinmesi: Alfa talasemide, alfa globin zincirlerinin kodlanmasından sorumlu genlerin bir kısmı silinir. - Hastalık formları: Alfa talaseminin hidrops fetalis, HbH hastalığı ve alfa talasemi özelliği gibi formları varken, beta talaseminin başlıca formları beta talasemi majör ve beta talasemi minördür. - Teşhis: Alfa talasemi tanısı globin zincir sentezi çalışmaları ile konulurken, beta talasemi için yüksek performanslı sıvı kromatografisi (HPLC) kullanılır.