Otoyol ücreti, kullanılan aracın sınıfına ve geçiş yapılan güzergahın uzunluğuna göre değişiklik gösterir. Araç sınıfları: 1. Sınıf: Aks aralığı 3,20 metre altında olan araçlar (otomobiller). 2. Sınıf: Aks aralığı 3,20 metre ve üzerinde olan 2 akslı araçlar (minibüs, otobüs). 3. Sınıf: Aks adedi (dingil sayısı) 3 olan araçlar. 4. Sınıf: Aks adedi 4 veya 5 olan araçlar (kamyonlar). 5. Sınıf: Aks adedi 6 ve daha fazla olan kamyon, tır, treyler gibi araçlar. 6. Sınıf: Motosikletler. Ücret hesaplama için aşağıdaki siteler kullanılabilir: isletme.otoyolas.com.tr; kuzeymarmaraotoyolu.com. Otoyol geçiş ücretleri genellikle Hızlı Geçiş Sistemi (HGS) ile tahsil edilir.